101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0700 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0700  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 237 aa  490  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2946  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.51 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.45 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.32 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.34 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1583  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1063  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.21 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.21 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.49 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.59 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.05 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0214  cAMP family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  22.16 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4881  putative cyclic-AMP receptor-like protein  22.95 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.69 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.07 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08461  Crp family regulatory proteins  32.1 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.836651  hitchhiker  0.00426427 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3232  cyclic nucleotide-binding protein  20.2 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.97 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.43 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.37 
 
 		 354 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.76 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5851  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.58 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930905  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0814  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 195 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08701  Crp family regulatory proteins  33.33 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  22.83 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07751  Crp family regulatory proteins  32.1 
 
 		 195 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08671  Crp family regulatory proteins  32.1 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277995  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4909  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.16 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  21.29 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0687  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.19 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.93 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.67 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.81 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3275  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.95 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  hitchhiker  0.00943034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.84 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.65 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.96 
 
 		 227 aa  46.2  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.82 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.9 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.49 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.49 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.49 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.49 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  22.49 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  22.49 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  22.49 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3897  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280734  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.8 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.97 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.22 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.49 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  19.37 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1376  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.41 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  18.92 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.9 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  24.56 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0675  cyclic nucleotide-binding protein  20.98 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2010  Crp family regulatory protein  30.77 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1904  CRP/FNR family transcriptional regulator  19.72 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603838  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.72 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0525745  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.68 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09541  Crp family regulatory protein  35.71 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230149  hitchhiker  0.000196756 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.01 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  20.96 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.2 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0503167  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3198  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 231 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 160 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.19 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.94 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 238 aa  42  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17701  regulatory proteins, Crp family protein  39.02 
 
 		 198 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>