49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2010 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2010  Crp family regulatory protein  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1586  cAMP family transcriptional regulator  85.16 
 
 		 182 aa  324  7e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.00767311 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0214  cAMP family transcriptional regulator  65.82 
 
 		 198 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08461  Crp family regulatory proteins  64.8 
 
 		 198 aa  244  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.836651  hitchhiker  0.00426427 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17701  regulatory proteins, Crp family protein  65.46 
 
 		 198 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09541  Crp family regulatory protein  64.62 
 
 		 197 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230149  hitchhiker  0.000196756 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07751  Crp family regulatory proteins  63.64 
 
 		 195 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08671  Crp family regulatory proteins  59.79 
 
 		 195 aa  228  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277995  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08701  Crp family regulatory proteins  63.07 
 
 		 195 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0814  CRP/FNR family transcriptional regulator  63.22 
 
 		 195 aa  224  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17661  regulatory proteins, Crp family protein  44.33 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1998  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00839318  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1574  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.255141  normal  0.0532067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1684  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.24693  normal  0.330754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.85 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.85 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3616  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 256 aa  48.9  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0115  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.1 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.2299 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.39 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.32 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0140  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0938698  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1750  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.76 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0990  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.596823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1663  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.231367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  37.5 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0700  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1291  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.06322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2869  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.35 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00060408  normal  0.537416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778777  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.59 
 
 		 403 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 249 aa  42  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2018  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  20.87 
 
 		 252 aa  41.6  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 248 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 248 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2246  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 233 aa  41.2  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>