49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_17701 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_17701  regulatory proteins, Crp family protein  100 
 
 		 198 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08461  Crp family regulatory proteins  80.81 
 
 		 198 aa  322  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.836651  hitchhiker  0.00426427 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0214  cAMP family transcriptional regulator  79.08 
 
 		 198 aa  314  6e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09541  Crp family regulatory protein  79.08 
 
 		 197 aa  306  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230149  hitchhiker  0.000196756 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07751  Crp family regulatory proteins  71.79 
 
 		 195 aa  289  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08671  Crp family regulatory proteins  71.28 
 
 		 195 aa  289  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277995  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0814  CRP/FNR family transcriptional regulator  71.5 
 
 		 195 aa  287  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08701  Crp family regulatory proteins  71.28 
 
 		 195 aa  285  2e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2010  Crp family regulatory protein  65.46 
 
 		 212 aa  258  3e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1586  cAMP family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 182 aa  246  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.00767311 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1998  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00839318  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1574  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.255141  normal  0.0532067 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17661  regulatory proteins, Crp family protein  31.38 
 
 		 260 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1684  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.24693  normal  0.330754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0115  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.66 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.2299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 223 aa  48.5  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0700  cyclic nucleotide-binding protein  35.38 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778777  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.92 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.92 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.92 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.61 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1750  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2113  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 313 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3616  CRP/FNR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 256 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0140  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0938698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 238 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1663  CRP/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.231367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1291  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 305 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.06322  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1146  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  38.71 
 
 		 244 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  41.38 
 
 		 244 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2219  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.54 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2356  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.03 
 
 		 254 aa  42  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2174  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 209 aa  42  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.576133 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11071  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family protein  30.93 
 
 		 233 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2491  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 393 aa  41.6  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116073 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40 
 
 		 250 aa  41.2  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40 
 
 		 250 aa  41.2  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1951  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40 
 
 		 250 aa  41.2  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80493  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 243 aa  41.2  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>