46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1586 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1586  cAMP family transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.00767311 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2010  Crp family regulatory protein  85.16 
 
 		 212 aa  324  5e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0214  cAMP family transcriptional regulator  70.62 
 
 		 198 aa  252  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08461  Crp family regulatory proteins  69.49 
 
 		 198 aa  248  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.836651  hitchhiker  0.00426427 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07751  Crp family regulatory proteins  62.5 
 
 		 195 aa  234  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08671  Crp family regulatory proteins  61.93 
 
 		 195 aa  231  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277995  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08701  Crp family regulatory proteins  61.93 
 
 		 195 aa  230  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0814  CRP/FNR family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 195 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17701  regulatory proteins, Crp family protein  66.67 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09541  Crp family regulatory protein  64.61 
 
 		 197 aa  227  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230149  hitchhiker  0.000196756 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17661  regulatory proteins, Crp family protein  41.24 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1998  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 207 aa  72  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00839318  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1574  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.255141  normal  0.0532067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1684  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.24693  normal  0.330754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0115  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.47 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.2299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 223 aa  51.2  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3616  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 256 aa  51.2  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.14 
 
 		 225 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1750  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 239 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1663  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.231367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0140  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 239 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0938698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 222 aa  45.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.95 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778777  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0990  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.596823  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.22 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2869  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.53 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00060408  normal  0.537416 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 		 232 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2174  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.576133 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6195  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 257 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4280  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 257 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0900166 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1332  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 238 aa  42  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407818  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  35 
 
 		 233 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3812  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 257 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279241  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1843  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  31.88 
 
 		 250 aa  42  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177159  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1291  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 305 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.06322  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  35 
 
 		 233 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0700  cyclic nucleotide-binding protein  27.4 
 
 		 237 aa  41.6  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 257 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>