36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1574 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1574  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.255141  normal  0.0532067 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1998  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00839318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17661  regulatory proteins, Crp family protein  33.33 
 
 		 260 aa  95.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07751  Crp family regulatory proteins  36.13 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08671  Crp family regulatory proteins  36.13 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277995  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0814  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08701  Crp family regulatory proteins  35.48 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08461  Crp family regulatory proteins  34.53 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.836651  hitchhiker  0.00426427 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0214  cAMP family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2010  Crp family regulatory protein  29.88 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1586  cAMP family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.00767311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17701  regulatory proteins, Crp family protein  33.33 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09541  Crp family regulatory protein  28.74 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230149  hitchhiker  0.000196756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191538  hitchhiker  0.00387918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0115  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.13 
 
 		 225 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.2299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  34.25 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.36 
 
 		 225 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.36 
 
 		 225 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.99 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2113  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 313 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02791  CRP family global nitrogen regulatory protein  31.51 
 
 		 244 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.696842  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03241  CRP family global nitrogen regulatory protein  34.25 
 
 		 243 aa  44.7  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 243 aa  44.7  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  31.51 
 
 		 244 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  31.51 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.88 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3616  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 256 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3658  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 249 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778777  normal  0.174596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>