98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1253 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1865  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.26 
 
 		 866 aa  677    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2122  phosphoenolpyruvate synthase  42.61 
 
 		 879 aa  669    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1046  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.96 
 
 		 864 aa  638    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1253  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 		 860 aa  1787    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0321  phosphoenolpyruvate synthase  46.6 
 
 		 892 aa  833    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0059  phosphoenolpyruvate synthase  39.98 
 
 		 866 aa  632  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0301  phosphoenolpyruvate synthase  38.11 
 
 		 862 aa  617  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2962  hypothetical protein  38.64 
 
 		 869 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3050  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.64 
 
 		 868 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3264  phosphoenolpyruvate synthase  37.7 
 
 		 896 aa  592  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.882195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3158  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.52 
 
 		 868 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2903  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.63 
 
 		 859 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2024  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.87 
 
 		 881 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20058  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0819  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.92 
 
 		 878 aa  537  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0105  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  31.36 
 
 		 567 aa  240  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0798  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.6 
 
 		 585 aa  212  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1678  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.68 
 
 		 588 aa  187  8e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3444  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.61 
 
 		 1016 aa  145  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0280  response regulator receiver protein  24.91 
 
 		 995 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.979989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0467  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  22.49 
 
 		 998 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.390764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 432 aa  66.6  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  25.47 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  24.55 
 
 		 788 aa  62.4  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  35.61 
 
 		 923 aa  58.9  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  21.72 
 
 		 891 aa  58.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  29.61 
 
 		 1115 aa  57  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  36.52 
 
 		 835 aa  54.7  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  23.33 
 
 		 793 aa  54.3  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.07 
 
 		 725 aa  53.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  27.94 
 
 		 364 aa  52.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  22.95 
 
 		 794 aa  52.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 803 aa  52  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  24.06 
 
 		 812 aa  52  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.08 
 
 		 840 aa  51.2  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  23.2 
 
 		 334 aa  51.2  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  35.64 
 
 		 414 aa  51.6  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  24.21 
 
 		 809 aa  51.2  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  25 
 
 		 810 aa  51.2  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  36.54 
 
 		 821 aa  50.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25.99 
 
 		 869 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  25.7 
 
 		 877 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  31.82 
 
 		 826 aa  50.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  26.5 
 
 		 898 aa  49.3  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  22.78 
 
 		 779 aa  48.9  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  20.04 
 
 		 757 aa  48.5  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  37.5 
 
 		 867 aa  48.5  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.18 
 
 		 887 aa  48.5  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  26.47 
 
 		 799 aa  48.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  26.47 
 
 		 799 aa  48.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  23.96 
 
 		 971 aa  48.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  30.71 
 
 		 956 aa  48.5  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.56 
 
 		 386 aa  48.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  22.94 
 
 		 809 aa  47.8  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  28.18 
 
 		 906 aa  47.8  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  32.32 
 
 		 793 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  22.11 
 
 		 761 aa  47.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  32.11 
 
 		 804 aa  47.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  31.96 
 
 		 814 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2917  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.45 
 
 		 692 aa  47.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.37 
 
 		 884 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.9 
 
 		 889 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  22.84 
 
 		 887 aa  47.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  35.64 
 
 		 1097 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  22.7 
 
 		 798 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  29.63 
 
 		 812 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  29.93 
 
 		 810 aa  46.6  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  22.12 
 
 		 885 aa  47  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  28.35 
 
 		 794 aa  47  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  25.29 
 
 		 799 aa  47  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  20.93 
 
 		 366 aa  46.6  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  21.41 
 
 		 824 aa  46.2  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  27.15 
 
 		 884 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  20.16 
 
 		 758 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3241  PEP-utilising protein mobile region  34.55 
 
 		 758 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  22.48 
 
 		 758 aa  46.2  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24.91 
 
 		 873 aa  46.2  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  37.11 
 
 		 812 aa  46.2  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  24.28 
 
 		 812 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  24.28 
 
 		 799 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  24.28 
 
 		 799 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  24.28 
 
 		 799 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  24.28 
 
 		 799 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  21.31 
 
 		 830 aa  45.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  22.01 
 
 		 885 aa  45.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.17 
 
 		 903 aa  45.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  24.28 
 
 		 799 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  22.68 
 
 		 793 aa  45.8  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  24.28 
 
 		 799 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  26.89 
 
 		 803 aa  45.4  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  20.57 
 
 		 769 aa  45.1  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  23.51 
 
 		 871 aa  45.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  25.48 
 
 		 806 aa  45.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  26.77 
 
 		 805 aa  45.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  25.48 
 
 		 871 aa  45.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  33.33 
 
 		 854 aa  44.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.33 
 
 		 389 aa  44.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.44 
 
 		 959 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>