131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0301 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2962  hypothetical protein  42.31 
 
 
869 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2122  phosphoenolpyruvate synthase  61.43 
 
 
879 aa  1076    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.948545 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0321  phosphoenolpyruvate synthase  41.79 
 
 
892 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0301  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
862 aa  1765    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0059  phosphoenolpyruvate synthase  58.53 
 
 
866 aa  1019    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2903  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  44.78 
 
 
859 aa  670    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603522 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1865  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45.34 
 
 
866 aa  766    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3050  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.95 
 
 
868 aa  644    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1046  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43.6 
 
 
864 aa  751    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3158  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.08 
 
 
868 aa  643    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1253  phosphoenolpyruvate synthase  38.11 
 
 
860 aa  617  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3264  phosphoenolpyruvate synthase  40.32 
 
 
896 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.882195  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2024  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.65 
 
 
881 aa  558  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20058  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0819  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.34 
 
 
878 aa  550  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0105  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  33.02 
 
 
567 aa  251  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1678  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.45 
 
 
588 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0798  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.36 
 
 
585 aa  179  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3444  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.44 
 
 
1016 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0280  response regulator receiver protein  29.36 
 
 
995 aa  162  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.979989  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0467  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.48 
 
 
998 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.390764 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  27.73 
 
 
433 aa  72.4  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  25.11 
 
 
432 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.51 
 
 
725 aa  62.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  32.91 
 
 
726 aa  60.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  34.76 
 
 
923 aa  60.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  22.16 
 
 
891 aa  59.7  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  28.76 
 
 
804 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  24.21 
 
 
884 aa  59.3  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  28.19 
 
 
794 aa  58.5  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  29.19 
 
 
334 aa  58.2  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  28.66 
 
 
779 aa  58.2  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  24.32 
 
 
874 aa  58.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.12 
 
 
835 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  31.43 
 
 
812 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  28.63 
 
 
799 aa  56.6  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  27.04 
 
 
793 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  34.96 
 
 
414 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  29.5 
 
 
799 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  29.5 
 
 
799 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  33.02 
 
 
906 aa  55.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  23.39 
 
 
803 aa  55.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  25.52 
 
 
868 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  24.8 
 
 
790 aa  54.7  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  24.31 
 
 
865 aa  54.7  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.89 
 
 
873 aa  54.3  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  28.4 
 
 
885 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  23.12 
 
 
891 aa  53.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  31.54 
 
 
803 aa  52.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  27.14 
 
 
814 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  31.76 
 
 
790 aa  52.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  31.08 
 
 
795 aa  52  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  30.56 
 
 
826 aa  52  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  31.3 
 
 
1097 aa  51.6  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  24.55 
 
 
769 aa  51.6  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  27.15 
 
 
790 aa  51.6  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  27.33 
 
 
795 aa  50.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  28.64 
 
 
809 aa  50.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.44 
 
 
861 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  21.69 
 
 
868 aa  50.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  21.58 
 
 
869 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.52 
 
 
840 aa  50.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  21.69 
 
 
868 aa  50.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  34.02 
 
 
885 aa  50.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  24.24 
 
 
810 aa  50.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  21.39 
 
 
869 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  27.62 
 
 
871 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.52 
 
 
902 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  30.41 
 
 
1115 aa  49.7  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.34 
 
 
950 aa  49.3  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  24.31 
 
 
758 aa  48.9  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2757  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 
825 aa  48.9  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  37.5 
 
 
821 aa  48.9  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  32.69 
 
 
971 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  25 
 
 
758 aa  48.5  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  34.45 
 
 
859 aa  48.5  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2917  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  40.91 
 
 
692 aa  48.5  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  20.86 
 
 
868 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.37 
 
 
821 aa  48.5  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  29.3 
 
 
364 aa  48.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  22.27 
 
 
789 aa  48.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000237182  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  26.02 
 
 
793 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  27.5 
 
 
853 aa  48.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  31.76 
 
 
801 aa  48.1  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.87 
 
 
971 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  21.58 
 
 
868 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.2 
 
 
811 aa  47.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  21.68 
 
 
790 aa  47.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  22.86 
 
 
791 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  29.93 
 
 
810 aa  47.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  26.28 
 
 
764 aa  47.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  23.12 
 
 
812 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  22.82 
 
 
804 aa  46.2  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  27.1 
 
 
366 aa  46.6  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  29.87 
 
 
893 aa  46.6  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  26 
 
 
805 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  30.96 
 
 
812 aa  46.6  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  33.09 
 
 
842 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  24.55 
 
 
757 aa  47  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  29.41 
 
 
868 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  31.73 
 
 
907 aa  46.2  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>