59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3158 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0321  phosphoenolpyruvate synthase  43.87 
 
 		 892 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1046  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43.15 
 
 		 864 aa  708    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3158  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 		 868 aa  1744    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2903  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  73.27 
 
 		 859 aa  1233    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2024  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  48.51 
 
 		 881 aa  743    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20058  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0059  phosphoenolpyruvate synthase  45.85 
 
 		 866 aa  661    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0301  phosphoenolpyruvate synthase  41.95 
 
 		 862 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1865  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  44.51 
 
 		 866 aa  737    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3050  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  99.19 
 
 		 868 aa  1728    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2122  phosphoenolpyruvate synthase  45.66 
 
 		 879 aa  663    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2962  hypothetical protein  97.89 
 
 		 869 aa  1682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0819  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  46.9 
 
 		 878 aa  759    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3264  phosphoenolpyruvate synthase  41.56 
 
 		 896 aa  617  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.882195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1253  phosphoenolpyruvate synthase  38.52 
 
 		 860 aa  593  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0105  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  30.98 
 
 		 567 aa  250  9e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0798  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.99 
 
 		 585 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1678  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.22 
 
 		 588 aa  172  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3444  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.88 
 
 		 1016 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0280  response regulator receiver protein  28.16 
 
 		 995 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.979989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0467  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.73 
 
 		 998 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.390764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  22.89 
 
 		 893 aa  58.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.53 
 
 		 835 aa  56.6  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.67 
 
 		 810 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  26.87 
 
 		 826 aa  54.7  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  27.4 
 
 		 885 aa  53.5  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  31.82 
 
 		 885 aa  52.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 433 aa  51.6  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  28.31 
 
 		 334 aa  51.6  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  36.45 
 
 		 726 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 		 762 aa  50.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  29.21 
 
 		 817 aa  50.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  24.5 
 
 		 788 aa  49.3  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  23.31 
 
 		 761 aa  48.9  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  32.69 
 
 		 1097 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  30.83 
 
 		 780 aa  48.5  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.75 
 
 		 902 aa  48.1  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  28.05 
 
 		 884 aa  47.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.04 
 
 		 889 aa  47.8  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  25.87 
 
 		 812 aa  47.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2557  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  30.5 
 
 		 631 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.09 
 
 		 852 aa  47  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  25.35 
 
 		 779 aa  46.2  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  32.33 
 
 		 923 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  25.48 
 
 		 877 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  26.9 
 
 		 795 aa  45.8  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  31.25 
 
 		 887 aa  45.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.7 
 
 		 873 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  23.87 
 
 		 302 aa  45.8  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.63 
 
 		 869 aa  45.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  25.29 
 
 		 761 aa  45.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  38.27 
 
 		 791 aa  45.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  27.22 
 
 		 790 aa  44.7  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  28.26 
 
 		 842 aa  44.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  22.3 
 
 		 758 aa  45.1  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  28.26 
 
 		 842 aa  44.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  30.63 
 
 		 785 aa  44.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  22.81 
 
 		 790 aa  44.3  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  22.7 
 
 		 810 aa  44.3  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>