76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1046 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3050  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43.27 
 
 		 868 aa  707    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2903  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.76 
 
 		 859 aa  711    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603522 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1865  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  48.5 
 
 		 866 aa  827    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1253  phosphoenolpyruvate synthase  37.96 
 
 		 860 aa  638    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0059  phosphoenolpyruvate synthase  42.43 
 
 		 866 aa  730    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0301  phosphoenolpyruvate synthase  43.6 
 
 		 862 aa  751    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0321  phosphoenolpyruvate synthase  42.36 
 
 		 892 aa  661    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2122  phosphoenolpyruvate synthase  43.87 
 
 		 879 aa  764    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1046  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 		 864 aa  1788    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3158  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43.15 
 
 		 868 aa  708    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2962  hypothetical protein  42.97 
 
 		 869 aa  717    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3264  phosphoenolpyruvate synthase  40.87 
 
 		 896 aa  627  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.882195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2024  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.05 
 
 		 881 aa  607  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20058  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0819  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.19 
 
 		 878 aa  607  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0105  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  33.64 
 
 		 567 aa  267  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0798  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.35 
 
 		 585 aa  195  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1678  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.99 
 
 		 588 aa  187  8e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0280  response regulator receiver protein  29.07 
 
 		 995 aa  159  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.979989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3444  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.01 
 
 		 1016 aa  157  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0467  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  23.79 
 
 		 998 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.390764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  24 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  26.53 
 
 		 334 aa  67  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  29.56 
 
 		 817 aa  58.5  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  25.82 
 
 		 923 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  26.73 
 
 		 803 aa  56.2  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.4 
 
 		 889 aa  52.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  30.26 
 
 		 791 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.78 
 
 		 884 aa  52  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.09 
 
 		 835 aa  51.2  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  22.76 
 
 		 757 aa  51.2  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  23.79 
 
 		 903 aa  50.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.54 
 
 		 1037 aa  50.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  24.36 
 
 		 366 aa  50.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  26.82 
 
 		 793 aa  49.7  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  21.36 
 
 		 758 aa  50.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  22.93 
 
 		 758 aa  49.3  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  29.13 
 
 		 780 aa  49.7  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  24.53 
 
 		 760 aa  49.3  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  25.2 
 
 		 906 aa  49.3  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  24.34 
 
 		 779 aa  48.9  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  25.79 
 
 		 859 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  29.09 
 
 		 726 aa  48.9  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  27.5 
 
 		 809 aa  47.8  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1972  phosphoenolpyruvate synthase  26.52 
 
 		 805 aa  47.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  21.15 
 
 		 891 aa  47.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  26.6 
 
 		 793 aa  47.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  23.91 
 
 		 814 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  27.97 
 
 		 785 aa  47.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  25.99 
 
 		 810 aa  46.6  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.54 
 
 		 725 aa  46.2  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25.95 
 
 		 873 aa  47  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  25.6 
 
 		 799 aa  47  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  34.55 
 
 		 389 aa  46.6  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  22.94 
 
 		 758 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  32.04 
 
 		 1097 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  22.68 
 
 		 359 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  27.53 
 
 		 799 aa  45.8  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  26.09 
 
 		 794 aa  46.2  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  24.66 
 
 		 790 aa  46.2  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  35.53 
 
 		 854 aa  45.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  21.52 
 
 		 840 aa  45.8  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  23.13 
 
 		 812 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  23.6 
 
 		 785 aa  45.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  26.02 
 
 		 825 aa  45.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.9 
 
 		 861 aa  45.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  31.17 
 
 		 842 aa  44.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  26.4 
 
 		 795 aa  44.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  31.17 
 
 		 842 aa  44.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  29.81 
 
 		 788 aa  44.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  25.44 
 
 		 885 aa  44.7  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  22.41 
 
 		 795 aa  44.3  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  26.83 
 
 		 1115 aa  44.3  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  25.44 
 
 		 885 aa  44.3  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87084  predicted protein  25.15 
 
 		 997 aa  44.3  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.019106  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.62 
 
 		 810 aa  44.3  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>