181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0321 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2962  hypothetical protein  45.24 
 
 
869 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2122  phosphoenolpyruvate synthase  45.6 
 
 
879 aa  660    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.948545 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0321  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
892 aa  1822    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0301  phosphoenolpyruvate synthase  41.79 
 
 
862 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0059  phosphoenolpyruvate synthase  46.13 
 
 
866 aa  652    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1253  phosphoenolpyruvate synthase  46.6 
 
 
860 aa  833    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1046  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.36 
 
 
864 aa  661    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3050  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43.87 
 
 
868 aa  651    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3158  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43.87 
 
 
868 aa  652    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1865  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.87 
 
 
866 aa  679    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2903  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.81 
 
 
859 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3264  phosphoenolpyruvate synthase  42.1 
 
 
896 aa  605  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.882195  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0819  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.89 
 
 
878 aa  550  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2024  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.24 
 
 
881 aa  541  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0105  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  31 
 
 
567 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0798  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.74 
 
 
585 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1678  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.08 
 
 
588 aa  188  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3444  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.1 
 
 
1016 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0280  response regulator receiver protein  27.32 
 
 
995 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.979989  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0467  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.54 
 
 
998 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.390764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  27.31 
 
 
432 aa  84.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  29.78 
 
 
923 aa  69.3  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  24.07 
 
 
433 aa  66.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  25.31 
 
 
893 aa  62.4  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  26.22 
 
 
884 aa  61.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  25.66 
 
 
787 aa  60.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  40.91 
 
 
956 aa  59.3  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  24.04 
 
 
334 aa  59.3  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  35.11 
 
 
835 aa  57.8  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  31.69 
 
 
826 aa  57.4  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24.36 
 
 
873 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  23.75 
 
 
801 aa  56.2  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  27.22 
 
 
790 aa  55.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  38.61 
 
 
726 aa  54.7  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 
762 aa  54.3  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  26.07 
 
 
364 aa  54.3  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  25.51 
 
 
798 aa  54.3  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  26.71 
 
 
825 aa  53.5  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  28.08 
 
 
906 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  24.76 
 
 
754 aa  53.5  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.53 
 
 
975 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  26.11 
 
 
795 aa  53.5  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.07 
 
 
840 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  32.76 
 
 
788 aa  52.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.33 
 
 
821 aa  52.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  24.52 
 
 
785 aa  52  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  32.46 
 
 
795 aa  52  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  31.53 
 
 
817 aa  52  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.91 
 
 
386 aa  51.2  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  23.76 
 
 
760 aa  51.2  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  34.26 
 
 
963 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 
907 aa  50.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.19 
 
 
725 aa  50.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  23.83 
 
 
810 aa  50.8  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.13 
 
 
889 aa  50.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.14 
 
 
887 aa  50.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  31.62 
 
 
791 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  25.35 
 
 
779 aa  50.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  29.17 
 
 
803 aa  50.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  29.78 
 
 
414 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  24.38 
 
 
791 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  25 
 
 
790 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  30.77 
 
 
780 aa  49.7  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  26.16 
 
 
758 aa  49.3  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  30.77 
 
 
785 aa  48.9  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  28.12 
 
 
794 aa  48.9  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  30.84 
 
 
808 aa  49.3  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.93 
 
 
887 aa  48.9  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  23.99 
 
 
801 aa  49.3  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  26.8 
 
 
885 aa  48.9  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  30.82 
 
 
803 aa  49.3  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  26.8 
 
 
971 aa  48.9  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  26 
 
 
814 aa  48.5  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  30.83 
 
 
799 aa  48.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.22 
 
 
869 aa  48.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  24.16 
 
 
799 aa  48.5  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2917  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  38.04 
 
 
692 aa  48.5  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.54 
 
 
810 aa  48.5  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0076  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.74 
 
 
408 aa  48.5  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  36.56 
 
 
1097 aa  48.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  24.57 
 
 
796 aa  48.1  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.83 
 
 
884 aa  48.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  24.57 
 
 
796 aa  48.1  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  25.91 
 
 
799 aa  47.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.63 
 
 
971 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  27.61 
 
 
1115 aa  47.8  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  30.06 
 
 
799 aa  47.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  29.73 
 
 
799 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  32.94 
 
 
815 aa  47.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  32.23 
 
 
793 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  34.68 
 
 
918 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  29.73 
 
 
799 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  29.73 
 
 
799 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  29.73 
 
 
812 aa  47.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  29.73 
 
 
799 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  29.73 
 
 
799 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  25.51 
 
 
804 aa  47.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  31.18 
 
 
842 aa  47.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4953  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.24 
 
 
687 aa  47.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  30.06 
 
 
799 aa  47.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>