104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2122 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2962  hypothetical protein  44.62 
 
 
869 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2122  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
879 aa  1792    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.948545 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0321  phosphoenolpyruvate synthase  45.6 
 
 
892 aa  660    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0301  phosphoenolpyruvate synthase  61.43 
 
 
862 aa  1076    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0059  phosphoenolpyruvate synthase  69.69 
 
 
866 aa  1230    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1253  phosphoenolpyruvate synthase  42.61 
 
 
860 aa  669    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2903  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  44.63 
 
 
859 aa  655    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603522 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1865  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  47.06 
 
 
866 aa  801    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3050  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45.66 
 
 
868 aa  665    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1046  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43.87 
 
 
864 aa  764    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3158  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45.66 
 
 
868 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3264  phosphoenolpyruvate synthase  41.51 
 
 
896 aa  631  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.882195  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0819  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.22 
 
 
878 aa  598  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2024  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.36 
 
 
881 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0105  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  30.93 
 
 
567 aa  252  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0798  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.9 
 
 
585 aa  194  6e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0280  response regulator receiver protein  29.74 
 
 
995 aa  174  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.979989  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1678  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.47 
 
 
588 aa  165  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3444  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.73 
 
 
1016 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0467  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.36 
 
 
998 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.390764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  23.68 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  34.15 
 
 
923 aa  60.8  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  24.7 
 
 
433 aa  60.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  26.9 
 
 
726 aa  57.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.89 
 
 
835 aa  57.4  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  22.95 
 
 
891 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  25.41 
 
 
884 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  29.11 
 
 
804 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  37.5 
 
 
821 aa  55.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  33.33 
 
 
725 aa  55.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  29.22 
 
 
799 aa  55.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  29.22 
 
 
799 aa  55.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  32.67 
 
 
760 aa  54.7  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.15 
 
 
861 aa  53.5  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  26.83 
 
 
334 aa  52.8  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.7 
 
 
884 aa  52.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  28.67 
 
 
801 aa  52  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  27.74 
 
 
795 aa  50.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  23.6 
 
 
853 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  31.03 
 
 
803 aa  50.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  27.39 
 
 
790 aa  50.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  29.93 
 
 
794 aa  50.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  22.44 
 
 
810 aa  50.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  29.8 
 
 
871 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  31.78 
 
 
788 aa  50.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  28.44 
 
 
906 aa  49.7  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  33.33 
 
 
859 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.33 
 
 
821 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  24.25 
 
 
812 aa  48.9  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.94 
 
 
873 aa  48.5  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  23.15 
 
 
824 aa  48.1  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  30.3 
 
 
826 aa  48.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  20.62 
 
 
874 aa  48.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  31.51 
 
 
812 aa  47  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  28.95 
 
 
795 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.66 
 
 
950 aa  47.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.57 
 
 
811 aa  47.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  31.43 
 
 
795 aa  46.6  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  29.77 
 
 
1097 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  29.57 
 
 
893 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  28.65 
 
 
885 aa  46.6  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  25.9 
 
 
793 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 
414 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  27.93 
 
 
780 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  34.55 
 
 
389 aa  47  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  27.93 
 
 
785 aa  46.6  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  34.69 
 
 
840 aa  47  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  29.52 
 
 
800 aa  46.2  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  27.88 
 
 
907 aa  45.8  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  23.22 
 
 
779 aa  45.8  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  22.67 
 
 
891 aa  45.8  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.61 
 
 
302 aa  46.2  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.22 
 
 
889 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  27.93 
 
 
785 aa  45.8  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  28.07 
 
 
810 aa  46.2  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  26.95 
 
 
793 aa  45.8  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  23.88 
 
 
359 aa  45.8  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  31.96 
 
 
885 aa  45.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4953  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.88 
 
 
687 aa  45.8  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  20 
 
 
869 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  22.98 
 
 
868 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  28.95 
 
 
790 aa  45.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  26.9 
 
 
799 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  26.9 
 
 
799 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  26.9 
 
 
799 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  26.9 
 
 
799 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  26.9 
 
 
812 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  26.9 
 
 
799 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  26.9 
 
 
799 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  27.33 
 
 
803 aa  45.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.82 
 
 
887 aa  45.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  26.9 
 
 
799 aa  45.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2757  phosphoenolpyruvate synthase  35.06 
 
 
825 aa  44.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112987 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  27.81 
 
 
1115 aa  44.7  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  19.78 
 
 
758 aa  44.7  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  25.62 
 
 
814 aa  44.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  23.2 
 
 
791 aa  44.3  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  26.72 
 
 
794 aa  44.7  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.82 
 
 
1037 aa  44.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  28.45 
 
 
795 aa  44.3  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>