67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0280 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0467  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  40.04 
 
 		 998 aa  683    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.390764 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3444  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  40.06 
 
 		 1016 aa  701    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0280  response regulator receiver protein  100 
 
 		 995 aa  2051    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.979989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0105  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  32.14 
 
 		 567 aa  226  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2122  phosphoenolpyruvate synthase  29.74 
 
 		 879 aa  175  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0059  phosphoenolpyruvate synthase  29.98 
 
 		 866 aa  164  8.000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0301  phosphoenolpyruvate synthase  29.36 
 
 		 862 aa  164  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1046  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.39 
 
 		 864 aa  164  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1678  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.12 
 
 		 588 aa  162  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3264  phosphoenolpyruvate synthase  28.41 
 
 		 896 aa  160  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.882195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1865  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.86 
 
 		 866 aa  147  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0819  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.28 
 
 		 878 aa  141  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1253  phosphoenolpyruvate synthase  25.27 
 
 		 860 aa  139  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0798  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.45 
 
 		 585 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0321  phosphoenolpyruvate synthase  27.73 
 
 		 892 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2962  hypothetical protein  28.44 
 
 		 869 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3158  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.62 
 
 		 868 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3050  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.8 
 
 		 868 aa  121  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2903  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.39 
 
 		 859 aa  121  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2024  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.64 
 
 		 881 aa  91.3  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  27.66 
 
 		 726 aa  67.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  22.63 
 
 		 761 aa  58.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.5 
 
 		 889 aa  55.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  26.24 
 
 		 891 aa  53.9  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  28.03 
 
 		 760 aa  53.9  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  27.31 
 
 		 334 aa  54.3  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  27.23 
 
 		 366 aa  53.5  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  24.68 
 
 		 761 aa  51.6  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  31.01 
 
 		 837 aa  51.6  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.85 
 
 		 887 aa  51.2  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  27.31 
 
 		 885 aa  50.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  27 
 
 		 865 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  30.23 
 
 		 790 aa  50.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.95 
 
 		 835 aa  50.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  25.74 
 
 		 762 aa  49.7  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  25.96 
 
 		 762 aa  49.7  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  26.87 
 
 		 885 aa  48.9  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.61 
 
 		 902 aa  48.9  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  32.16 
 
 		 923 aa  49.3  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  23.3 
 
 		 795 aa  48.9  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  26.57 
 
 		 779 aa  48.5  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  22.67 
 
 		 794 aa  48.1  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2388  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.9 
 
 		 812 aa  48.1  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.48 
 
 		 810 aa  48.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  29.65 
 
 		 791 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  22.97 
 
 		 868 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 707 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.52 
 
 		 887 aa  47.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  29.65 
 
 		 791 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  27.8 
 
 		 825 aa  47.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  22.92 
 
 		 794 aa  47.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  28.45 
 
 		 804 aa  47  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  20.77 
 
 		 868 aa  47  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  21.74 
 
 		 868 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.9 
 
 		 840 aa  46.2  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  28.03 
 
 		 828 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  28.93 
 
 		 1062 aa  45.8  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  29.07 
 
 		 791 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  29.07 
 
 		 791 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.7 
 
 		 884 aa  45.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.95 
 
 		 1037 aa  45.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25.45 
 
 		 868 aa  45.1  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  27.92 
 
 		 359 aa  45.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  25.52 
 
 		 871 aa  45.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  28.09 
 
 		 414 aa  45.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  25.42 
 
 		 758 aa  44.7  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.94 
 
 		 830 aa  44.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>