83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1865 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2962  hypothetical protein  45.08 
 
 		 869 aa  748    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0301  phosphoenolpyruvate synthase  45.34 
 
 		 862 aa  766    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0321  phosphoenolpyruvate synthase  42.87 
 
 		 892 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2903  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45.06 
 
 		 859 aa  731    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3264  phosphoenolpyruvate synthase  41.5 
 
 		 896 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.882195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1865  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 		 866 aa  1790    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2122  phosphoenolpyruvate synthase  47.06 
 
 		 879 aa  801    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0059  phosphoenolpyruvate synthase  47.36 
 
 		 866 aa  774    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1253  phosphoenolpyruvate synthase  41.26 
 
 		 860 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3050  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  44.62 
 
 		 868 aa  739    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1046  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  48.5 
 
 		 864 aa  827    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3158  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  44.51 
 
 		 868 aa  736    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0819  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.53 
 
 		 878 aa  601  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2024  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.27 
 
 		 881 aa  566  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0105  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  30.77 
 
 		 567 aa  249  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0798  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.68 
 
 		 585 aa  193  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1678  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.35 
 
 		 588 aa  177  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3444  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.78 
 
 		 1016 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0280  response regulator receiver protein  26.86 
 
 		 995 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.979989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0467  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24.52 
 
 		 998 aa  97.8  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.390764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  27.45 
 
 		 826 aa  58.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  26.51 
 
 		 842 aa  57.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  26.22 
 
 		 865 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  23.56 
 
 		 873 aa  54.7  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  25.97 
 
 		 884 aa  53.5  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  30.67 
 
 		 963 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  24.78 
 
 		 868 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  23.78 
 
 		 785 aa  52.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  31.5 
 
 		 780 aa  52.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  30.88 
 
 		 1097 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  25.13 
 
 		 869 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.63 
 
 		 889 aa  52.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  27.78 
 
 		 923 aa  52.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  23.33 
 
 		 868 aa  52  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  32.08 
 
 		 788 aa  52  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  24.5 
 
 		 891 aa  52.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.43 
 
 		 971 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  28.03 
 
 		 334 aa  51.2  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  21.47 
 
 		 866 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.33 
 
 		 835 aa  50.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.43 
 
 		 810 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  25 
 
 		 779 aa  50.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  23.87 
 
 		 803 aa  49.3  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.83 
 
 		 725 aa  49.3  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  23.87 
 
 		 302 aa  48.9  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  23.91 
 
 		 868 aa  48.9  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.53 
 
 		 821 aa  48.9  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.71 
 
 		 971 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  25.76 
 
 		 870 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  22.43 
 
 		 869 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  23.18 
 
 		 868 aa  48.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.52 
 
 		 891 aa  48.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  23.45 
 
 		 785 aa  48.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  22.75 
 
 		 868 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.03 
 
 		 884 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  22.73 
 
 		 887 aa  47  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  25 
 
 		 758 aa  47.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  22.75 
 
 		 868 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  23.61 
 
 		 825 aa  47  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  22.48 
 
 		 760 aa  47  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  23.9 
 
 		 902 aa  46.6  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  23.53 
 
 		 868 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  32.09 
 
 		 726 aa  47  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  24.47 
 
 		 758 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  20.42 
 
 		 757 aa  46.6  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  24.84 
 
 		 758 aa  46.2  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  26.82 
 
 		 821 aa  45.8  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  29.79 
 
 		 799 aa  46.2  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  25.83 
 
 		 906 aa  45.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  25 
 
 		 885 aa  45.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  20.11 
 
 		 758 aa  45.8  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  24.84 
 
 		 758 aa  45.4  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  33.98 
 
 		 956 aa  45.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  25 
 
 		 885 aa  45.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.38 
 
 		 386 aa  45.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  27.27 
 
 		 1115 aa  45.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.42 
 
 		 887 aa  45.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.19 
 
 		 903 aa  45.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.84 
 
 		 868 aa  44.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  31.19 
 
 		 791 aa  44.3  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.58 
 
 		 867 aa  44.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>