194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1678 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1678  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  100 
 
 
588 aa  1208    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0105  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  40.39 
 
 
567 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0798  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38.14 
 
 
585 aa  379  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3264  phosphoenolpyruvate synthase  33.21 
 
 
896 aa  246  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.882195  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3444  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.49 
 
 
1016 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0321  phosphoenolpyruvate synthase  33.08 
 
 
892 aa  204  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1046  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.99 
 
 
864 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1253  phosphoenolpyruvate synthase  27.68 
 
 
860 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0301  phosphoenolpyruvate synthase  32.45 
 
 
862 aa  198  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0819  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.54 
 
 
878 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1865  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.35 
 
 
866 aa  193  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0059  phosphoenolpyruvate synthase  29.86 
 
 
866 aa  192  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3050  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.34 
 
 
868 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3158  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.22 
 
 
868 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2962  hypothetical protein  29.91 
 
 
869 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2903  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.8 
 
 
859 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603522 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2122  phosphoenolpyruvate synthase  29.47 
 
 
879 aa  180  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.948545 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0467  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.6 
 
 
998 aa  177  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.390764 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0280  response regulator receiver protein  31.94 
 
 
995 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.979989  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2024  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.3 
 
 
881 aa  171  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20058  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  25.7 
 
 
790 aa  69.3  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  39.66 
 
 
854 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 
726 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  27.09 
 
 
790 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  32.79 
 
 
817 aa  62.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  26.92 
 
 
788 aa  62  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  25.95 
 
 
790 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  33.13 
 
 
334 aa  61.2  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  24.01 
 
 
815 aa  60.8  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  24.93 
 
 
791 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  30.18 
 
 
890 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  25.22 
 
 
791 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  25.22 
 
 
791 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.78 
 
 
887 aa  58.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  24.87 
 
 
787 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  25.8 
 
 
792 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  25.4 
 
 
796 aa  57.4  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  22.57 
 
 
795 aa  57  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  24.5 
 
 
791 aa  57  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  25.22 
 
 
791 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  23.08 
 
 
795 aa  57  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  25.22 
 
 
791 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24.63 
 
 
840 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  24.13 
 
 
793 aa  56.2  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  24.46 
 
 
778 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  23.32 
 
 
795 aa  56.2  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  25.75 
 
 
1097 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1972  phosphoenolpyruvate synthase  26.5 
 
 
805 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  25.63 
 
 
795 aa  55.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  28.74 
 
 
366 aa  55.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  24.93 
 
 
791 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  24.93 
 
 
791 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3011  phosphoenolpyruvate synthase  25.72 
 
 
795 aa  54.3  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  29.63 
 
 
762 aa  53.9  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  23.92 
 
 
790 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  29.88 
 
 
810 aa  53.9  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  26.03 
 
 
792 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  25.57 
 
 
779 aa  53.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  23.04 
 
 
790 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  24.14 
 
 
891 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  25.71 
 
 
792 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 
758 aa  53.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.66 
 
 
902 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  29.02 
 
 
794 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  29.02 
 
 
794 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  29.02 
 
 
794 aa  53.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  25.45 
 
 
792 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  22.81 
 
 
790 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  25.81 
 
 
796 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  28.07 
 
 
792 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  25.09 
 
 
799 aa  52  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25.3 
 
 
887 aa  52  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  21.66 
 
 
789 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.63 
 
 
889 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  21.66 
 
 
789 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  23.96 
 
 
801 aa  52  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  30.23 
 
 
809 aa  52  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  21.66 
 
 
789 aa  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  22.48 
 
 
795 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 
870 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  29.05 
 
 
810 aa  51.6  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  25.9 
 
 
809 aa  51.6  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  24.57 
 
 
792 aa  51.6  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.47 
 
 
852 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  26.17 
 
 
800 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  37.5 
 
 
884 aa  51.6  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  25.47 
 
 
792 aa  51.2  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  23.88 
 
 
830 aa  51.2  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  24.53 
 
 
792 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  25.09 
 
 
792 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  22.88 
 
 
791 aa  50.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0593  phosphoenolpyruvate synthase  23.84 
 
 
799 aa  50.8  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.230146  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  25.09 
 
 
792 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  25.09 
 
 
792 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  25.09 
 
 
792 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  25.09 
 
 
792 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  25.09 
 
 
792 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  25.45 
 
 
796 aa  50.8  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  25.09 
 
 
792 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.4 
 
 
810 aa  50.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>