132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1523 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1523  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3221  cytochrome c assembly protein  46.08 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  47.91 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3840  cytochrome c assembly protein  46.73 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  44.34 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5083  cytochrome c assembly protein  48.13 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.402739  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  41.79 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  38.65 
 
 		 319 aa  98.2  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  35.66 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  29.59 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  36.93 
 
 		 321 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  34.44 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  34.84 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  35.66 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0755  cytochrome c assembly protein  33.75 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4437  cytochrome c assembly protein  34.38 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  31.02 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  31.33 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  30.21 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4369  cytochrome c assembly protein  33.52 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  34.29 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  31.03 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  27.07 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  26.98 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  30.21 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  25.67 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  28.27 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  26.84 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1486  cytochrome c assembly protein  30.28 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  23.91 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  30.99 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  26.53 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  24.71 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  28 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  28.93 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  24.16 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  23.9 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  25.16 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  25.32 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  25.61 
 
 		 274 aa  54.3  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  24.28 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  26.88 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  25 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  25.88 
 
 		 262 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  26.78 
 
 		 260 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  24.75 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  25.3 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  25.5 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  24.71 
 
 		 261 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  28.04 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  23.49 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  29.17 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  27.12 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  29.37 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4002  heme exporter protein CcmC  25.37 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  23.81 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.08 
 
 		 272 aa  48.9  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  25.83 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  26.71 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  23.65 
 
 		 261 aa  48.5  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  24.85 
 
 		 246 aa  48.5  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  23.65 
 
 		 262 aa  48.5  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  24.26 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  24.6 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  20.71 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  27.12 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  24.39 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  28.67 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1387  heme exporter protein CcmC  30.86 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  26.32 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  24.59 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  28.34 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  23.76 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  23.78 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  28.39 
 
 		 284 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  25.86 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  22.49 
 
 		 247 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  25.9 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  25.9 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.31 
 
 		 405 aa  46.2  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  20.53 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  25 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  24.29 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  20.53 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1853  heme exporter protein C  20.13 
 
 		 243 aa  45.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.024303  normal  0.648082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  26.8 
 
 		 283 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  23.78 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  23.78 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  24.1 
 
 		 250 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  23.78 
 
 		 255 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  22.54 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  23.73 
 
 		 265 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  25.86 
 
 		 249 aa  45.1  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  24.21 
 
 		 268 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.29 
 
 		 284 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0749  cytochrome c assembly protein  37.84 
 
 		 472 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  24.68 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  24.21 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3316  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.13 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1411  heme exporter protein CcmC  21.23 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11561  normal  0.597775 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>