More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3221 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3221  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  53.49 
 
 		 240 aa  250  9.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  54.67 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3840  cytochrome c assembly protein  49.77 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5083  cytochrome c assembly protein  49.77 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.402739  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1523  cytochrome c assembly protein  46.08 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  46.77 
 
 		 242 aa  190  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  36.75 
 
 		 319 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  27.17 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0755  cytochrome c assembly protein  35.1 
 
 		 335 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  32.75 
 
 		 320 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  31.28 
 
 		 246 aa  88.6  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4437  cytochrome c assembly protein  35.76 
 
 		 335 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  34.03 
 
 		 321 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4369  cytochrome c assembly protein  33.13 
 
 		 321 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  31.03 
 
 		 244 aa  85.5  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  29.76 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  32.85 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  29.37 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  28.3 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  36.07 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  30.77 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  28.73 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  31.61 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  31.51 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  31.25 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  31.25 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  33.8 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  28.41 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  26.05 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  27.12 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  29.37 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  29.41 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  27.97 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  27.97 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  25.85 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  32.5 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  25.66 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  25.66 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  35.29 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  30.51 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  29.31 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  28.45 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  27.89 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  34.45 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  26.72 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  29.13 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.89 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  29.34 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  31.58 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  28.99 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  31.86 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.83 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  26.96 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  26.96 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  25 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  27.89 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  23 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  25.22 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  25.22 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  27.89 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  24.74 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  23.94 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  26.96 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  26.39 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  26.39 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  25.85 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  28.24 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  28.7 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  26.52 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  25.22 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  24.65 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  33.33 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  26.32 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  25.22 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  24.56 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  23.94 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  23.68 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  26.06 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  24 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  24.82 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  39.36 
 
 		 312 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  26.62 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0523  cytochrome c assembly protein  27.67 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  26.76 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.19 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  34.15 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1103  cytochrome c assembly protein  29.23 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1853  heme exporter protein C  25.23 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.024303  normal  0.648082 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  29.52 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  26.83 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  27.83 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  39.73 
 
 		 304 aa  57  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  26.14 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  22.81 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  26.83 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  24.65 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  24.62 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  24.65 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>