198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0334 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 244 aa  475  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  45.97 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  39.11 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  38.6 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  43.39 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  40.09 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  36.41 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  37.45 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  37.45 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  37.14 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  40.79 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  37.26 
 
 		 224 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  39.8 
 
 		 256 aa  131  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  39.13 
 
 		 230 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  37.26 
 
 		 265 aa  128  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  38.5 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  37.44 
 
 		 260 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  42.37 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  37.91 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  35.78 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0509  CcmC family heme exporter protein  35.68 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0176154  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  38.81 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  36.92 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  38.03 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  37.86 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1387  heme exporter protein CcmC  34.86 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  39.33 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  38.31 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  36.49 
 
 		 243 aa  118  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  34.58 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.44 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  37.33 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  42.01 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  43.98 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  37.71 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  36.54 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  37.14 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  34.88 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  36.68 
 
 		 231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  35.68 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  37.5 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  41.36 
 
 		 239 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  36.27 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  34.7 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  39.58 
 
 		 269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  33.68 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  36.81 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  34.7 
 
 		 268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  33.04 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  36.84 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  36.14 
 
 		 249 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  32.87 
 
 		 252 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  33.5 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  34.86 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  32.26 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  39.59 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  39.23 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  35.38 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  36.32 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  31.06 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  33.95 
 
 		 246 aa  108  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  36.2 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  35.96 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  34.27 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.39 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.86 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  36.71 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  40.21 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  43.06 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  39.35 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  37.2 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  38.96 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  38.96 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  34.52 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  31.46 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  34.52 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1958  heme exporter protein CcmC  39.02 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  37.43 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0889  heme exporter protein CcmC  38.07 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  37.01 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  36.77 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  33.64 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  44.44 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  36.36 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  36.36 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  34.3 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  36.36 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  35.8 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  35.9 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  33.71 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  35.06 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  36.42 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0920  heme exporter protein CcmC  37.61 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  33.16 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  37.42 
 
 		 319 aa  99.8  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  37.57 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  37.58 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  39.61 
 
 		 250 aa  99  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  37.02 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  37.58 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>