190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3500 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  100 
 
 		 229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  46.15 
 
 		 256 aa  181  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  49.74 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  43.75 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  48.7 
 
 		 268 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  48.7 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  43.75 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  48.77 
 
 		 254 aa  177  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  47.12 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  48.5 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  44.69 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  50.77 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  47.24 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  42.39 
 
 		 265 aa  175  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  45.07 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  40.59 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  44.17 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  46.32 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  45.28 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  45.37 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  46.15 
 
 		 244 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  46.8 
 
 		 245 aa  170  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  46.8 
 
 		 245 aa  170  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  46.8 
 
 		 245 aa  170  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  46.8 
 
 		 245 aa  170  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  46.8 
 
 		 245 aa  170  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  45.41 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  46.8 
 
 		 245 aa  170  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  43.37 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  46.8 
 
 		 245 aa  170  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  41.23 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  46.8 
 
 		 245 aa  170  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  46.8 
 
 		 245 aa  170  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  44.23 
 
 		 234 aa  169  2e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  50 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  43.81 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  43.59 
 
 		 243 aa  169  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  43.48 
 
 		 245 aa  168  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  43.48 
 
 		 245 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  42.92 
 
 		 253 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  43.48 
 
 		 245 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  45.67 
 
 		 270 aa  168  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  44.71 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  44.39 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  44.88 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  46.34 
 
 		 245 aa  165  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  50.26 
 
 		 269 aa  165  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  47.57 
 
 		 247 aa  165  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  44.74 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  42.58 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  44.98 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  49.75 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  44.6 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  47.83 
 
 		 248 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  47.83 
 
 		 248 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  47.28 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  40.64 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  43.54 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  47.28 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  42.03 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  48.47 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  46.74 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  46.74 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  39.73 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  39.73 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  46.74 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  39.73 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  42.58 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  44.04 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  46.74 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  44.04 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  44.72 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  39.27 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  46.74 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  46.74 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  44.04 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  46.08 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  46.43 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  42.11 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  42.11 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  47.59 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  41.55 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  43.39 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  40.45 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  42.03 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  41.88 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  37.9 
 
 		 248 aa  154  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  46.48 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  43.87 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  39.55 
 
 		 248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  43.08 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  51.37 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  37.9 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  37.9 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  37.9 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  42.63 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  42.08 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  43.08 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  37.44 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  42.2 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>