178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1579 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  94.42 
 
 		 251 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  90.69 
 
 		 254 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  86.75 
 
 		 251 aa  441  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  89.47 
 
 		 255 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  89.47 
 
 		 255 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  89.88 
 
 		 255 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  82.47 
 
 		 252 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  82.47 
 
 		 252 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  80.97 
 
 		 267 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  81.93 
 
 		 250 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  83.4 
 
 		 267 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  61.38 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1958  heme exporter protein CcmC  66.39 
 
 		 247 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  54.22 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  53.41 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  57.32 
 
 		 247 aa  278  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  56.9 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  55.23 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  55.23 
 
 		 248 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  55.23 
 
 		 248 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  55.23 
 
 		 248 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  54.81 
 
 		 248 aa  271  9e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  51.63 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  54.81 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  53.69 
 
 		 248 aa  269  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  55.04 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  54.13 
 
 		 243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  53.97 
 
 		 248 aa  268  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  57.32 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  53.97 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  53.97 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  55.04 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  54.92 
 
 		 262 aa  265  4e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  54.51 
 
 		 262 aa  264  8.999999999999999e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  51.23 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  53.97 
 
 		 248 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  52.46 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  55.37 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  56.49 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  49.19 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  53.56 
 
 		 248 aa  252  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  52.92 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  52.92 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  52.92 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  52.92 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  52.92 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  52.92 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  52.92 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  52.92 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  52.92 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  51.87 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0213  heme exporter protein CcmC  53.56 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  47.95 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  47.95 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  47.95 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1868  heme exporter protein CcmC  47.56 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.995735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0889  heme exporter protein CcmC  47.58 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4289  heme exporter protein CcmC  53.56 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743229 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0920  heme exporter protein CcmC  47.18 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  48.37 
 
 		 271 aa  235  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  47.72 
 
 		 246 aa  235  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  50.42 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  50.42 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  50 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  50 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  46.89 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  49.58 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  49.58 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  49.58 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  49.58 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  49.58 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  49.58 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  48.55 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  46.25 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  48.77 
 
 		 245 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  48.7 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  45.26 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  47.08 
 
 		 274 aa  217  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  50.41 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  48.96 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  45.19 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  43.44 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  46.93 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  43.44 
 
 		 262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  46.49 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  46.99 
 
 		 256 aa  211  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  48.35 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  47.06 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  47.06 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  46.22 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00215  heme exporter protein C; cytochrome C-type biogenesis protein  48.54 
 
 		 252 aa  205  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.83 
 
 		 239 aa  205  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  45.53 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  45.22 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  44.3 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  43.86 
 
 		 243 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  45.06 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  46.29 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  42.74 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>