198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0522 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  100 
 
 		 244 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  94.67 
 
 		 244 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  83.95 
 
 		 243 aa  421  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  83.95 
 
 		 243 aa  420  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  90.98 
 
 		 244 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  87.82 
 
 		 258 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  85.6 
 
 		 250 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  65.97 
 
 		 261 aa  337  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  65.97 
 
 		 262 aa  337  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  65.7 
 
 		 254 aa  330  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  68.2 
 
 		 256 aa  329  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  65.45 
 
 		 260 aa  329  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  68.2 
 
 		 256 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  64.85 
 
 		 265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  67.49 
 
 		 253 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  67.08 
 
 		 253 aa  321  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  64.88 
 
 		 254 aa  314  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  62.4 
 
 		 265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  65.55 
 
 		 251 aa  308  8e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  65.8 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  67.32 
 
 		 268 aa  294  7e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  63.64 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  63.64 
 
 		 268 aa  292  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  64.32 
 
 		 254 aa  291  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  54.85 
 
 		 259 aa  275  6e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  58.4 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  66.24 
 
 		 255 aa  251  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  51.04 
 
 		 270 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  52.65 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  55.02 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  48.47 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  48.47 
 
 		 252 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  49.78 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  53.5 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  48.68 
 
 		 250 aa  221  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  48.9 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  50.44 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  51.53 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  49.35 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  46.47 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  46.47 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  47.37 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  48.25 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  46.06 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  46.06 
 
 		 248 aa  214  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  49.57 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  49.57 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  49.57 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  49.57 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  49.57 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  49.57 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  49.57 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  49.56 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  49.57 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  49.57 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  48.68 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  47.54 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  48.25 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  49.57 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  49.57 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  48.25 
 
 		 247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  46.49 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  48.67 
 
 		 245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  48.67 
 
 		 245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  48.67 
 
 		 245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  46.93 
 
 		 245 aa  211  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  49.14 
 
 		 248 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  48.25 
 
 		 246 aa  211  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  49.14 
 
 		 248 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.81 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  49.14 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  49.14 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  49.14 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  45.65 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  49.14 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  49.14 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  49.14 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  44.4 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  49.12 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  49.12 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  44.4 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  44.4 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  44.4 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  49.12 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  45.28 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  43.98 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  53.19 
 
 		 239 aa  204  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  46.72 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  49.78 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  44.12 
 
 		 246 aa  201  9e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  48.55 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  43.91 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  41.96 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  48.31 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  44.26 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  49.56 
 
 		 263 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  48.51 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  48.51 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  45.49 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4002  heme exporter protein CcmC  48.28 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>