178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3413 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  100 
 
 
248 aa  497  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  61.45 
 
 
254 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  61.38 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  62.3 
 
 
250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  60.57 
 
 
251 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  59.84 
 
 
252 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  61.29 
 
 
255 aa  299  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  59.84 
 
 
252 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  60.89 
 
 
255 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  60.89 
 
 
255 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  58.87 
 
 
267 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  59.68 
 
 
251 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  59.27 
 
 
267 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  51.02 
 
 
252 aa  251  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  51.45 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  51.45 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1958  heme exporter protein CcmC  56.2 
 
 
247 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  47.52 
 
 
248 aa  237  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  49.59 
 
 
248 aa  236  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  49.38 
 
 
262 aa  236  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  50.84 
 
 
250 aa  235  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  47.93 
 
 
248 aa  235  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  47.52 
 
 
248 aa  234  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  47.52 
 
 
248 aa  234  9e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  47.52 
 
 
248 aa  234  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  47.77 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  48.37 
 
 
248 aa  231  6e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  48.35 
 
 
250 aa  231  8.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  48.35 
 
 
243 aa  229  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  49.39 
 
 
248 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  47.54 
 
 
247 aa  228  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  46.96 
 
 
247 aa  228  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  48.58 
 
 
248 aa  228  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  46.69 
 
 
248 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 
245 aa  226  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  46.69 
 
 
248 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 
245 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  46.69 
 
 
248 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 
245 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  46.69 
 
 
248 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  48.13 
 
 
260 aa  225  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  47.37 
 
 
248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  47.18 
 
 
245 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  47.18 
 
 
245 aa  221  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  47.18 
 
 
245 aa  221  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  47.18 
 
 
245 aa  221  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  47.18 
 
 
245 aa  221  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  47.18 
 
 
245 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  47.18 
 
 
245 aa  221  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  47.18 
 
 
245 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  47.18 
 
 
245 aa  221  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  47.68 
 
 
245 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.28 
 
 
250 aa  218  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  46.53 
 
 
248 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0213  heme exporter protein CcmC  47.77 
 
 
248 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  51.18 
 
 
248 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  51.18 
 
 
248 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  51.18 
 
 
248 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  51.18 
 
 
248 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  50.71 
 
 
248 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  50.71 
 
 
248 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  50.71 
 
 
248 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  50.71 
 
 
248 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  50.71 
 
 
248 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  50.71 
 
 
248 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4289  heme exporter protein CcmC  47.37 
 
 
248 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000743229 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  45.45 
 
 
243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0920  heme exporter protein CcmC  43.15 
 
 
251 aa  198  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0889  heme exporter protein CcmC  43.15 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  45.71 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  47.79 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  46.46 
 
 
246 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1868  heme exporter protein CcmC  41.06 
 
 
246 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.995735  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  41.74 
 
 
246 aa  188  9e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  43.27 
 
 
250 aa  186  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  40.74 
 
 
246 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  42.49 
 
 
270 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  43.27 
 
 
250 aa  186  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  42.21 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  44.61 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  43.83 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  48.15 
 
 
256 aa  181  9.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00215  heme exporter protein C; cytochrome C-type biogenesis protein  44.03 
 
 
252 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  44.68 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  42.93 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  42.21 
 
 
256 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  42.36 
 
 
265 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  41.99 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  41.92 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  41.92 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  41.35 
 
 
265 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  40.98 
 
 
247 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  40.35 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  41.35 
 
 
254 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  42.02 
 
 
256 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  40.56 
 
 
254 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  38.91 
 
 
256 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  39.59 
 
 
268 aa  168  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  39.02 
 
 
268 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  39.02 
 
 
268 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>