175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1868 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1868  heme exporter protein CcmC  100 
 
 
246 aa  494  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.995735  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  50.81 
 
 
252 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  51.67 
 
 
252 aa  278  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  51.87 
 
 
250 aa  275  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  50.21 
 
 
254 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  50.4 
 
 
251 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.56 
 
 
251 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.92 
 
 
251 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  50.62 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  50.62 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  50.62 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.5 
 
 
267 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  48.75 
 
 
267 aa  234  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  46.5 
 
 
248 aa  228  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  45.9 
 
 
250 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  47.08 
 
 
248 aa  225  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  45.42 
 
 
248 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  45.42 
 
 
248 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  45.42 
 
 
248 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  45 
 
 
248 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1958  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 
247 aa  223  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  45.42 
 
 
248 aa  222  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  45.08 
 
 
247 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  43.85 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  44.67 
 
 
247 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  44.17 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  43.75 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  44.17 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  44.17 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  44.26 
 
 
248 aa  217  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  43.75 
 
 
248 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  43.57 
 
 
243 aa  216  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  44.17 
 
 
248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  43.33 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  45.64 
 
 
248 aa  211  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  43.03 
 
 
248 aa  208  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  43.03 
 
 
245 aa  208  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  41.98 
 
 
250 aa  207  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  41.06 
 
 
248 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  42.62 
 
 
245 aa  205  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  42.62 
 
 
245 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  42.62 
 
 
245 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0920  heme exporter protein CcmC  42.62 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0889  heme exporter protein CcmC  42.62 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  44.4 
 
 
250 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  41.8 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  41.8 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  41.8 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  41.8 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  41.8 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  41.8 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  41.8 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  41.8 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  41.8 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0213  heme exporter protein CcmC  43.75 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  41.56 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  42.92 
 
 
246 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  45.42 
 
 
243 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4289  heme exporter protein CcmC  43.33 
 
 
248 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000743229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  41.98 
 
 
245 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  39.58 
 
 
246 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  39.33 
 
 
246 aa  185  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  40.57 
 
 
248 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  40.57 
 
 
248 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  40.16 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  40.16 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  39.42 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  40.16 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  40.16 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  40.16 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  40.16 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  39.42 
 
 
262 aa  182  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  43.15 
 
 
247 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  40.16 
 
 
248 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  40.16 
 
 
248 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  40.91 
 
 
246 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  43.61 
 
 
265 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  46.75 
 
 
256 aa  178  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  43.11 
 
 
262 aa  178  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  43.11 
 
 
261 aa  178  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  40.98 
 
 
250 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  40.98 
 
 
250 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  43.81 
 
 
263 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  40.76 
 
 
243 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  44.69 
 
 
256 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  42.86 
 
 
274 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  38.43 
 
 
270 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  40.5 
 
 
244 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  39.17 
 
 
256 aa  175  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  40.76 
 
 
243 aa  175  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  43.1 
 
 
260 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  40.5 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  37.66 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  39.43 
 
 
254 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  43.48 
 
 
254 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4002  heme exporter protein CcmC  43.35 
 
 
261 aa  171  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  40 
 
 
249 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  41.8 
 
 
256 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  42.48 
 
 
259 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  41 
 
 
265 aa  168  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>