223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00863 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  100 
 
 
250 aa  494  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  100 
 
 
250 aa  494  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  75.1 
 
 
256 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  67.36 
 
 
247 aa  334  7e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  66.53 
 
 
247 aa  331  8e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00215  heme exporter protein C; cytochrome C-type biogenesis protein  59.49 
 
 
252 aa  260  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  53.81 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  50.41 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  51.23 
 
 
247 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  50.82 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  51.71 
 
 
250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  52.32 
 
 
250 aa  231  9e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  53.42 
 
 
243 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  50.21 
 
 
252 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  50.21 
 
 
252 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  47.46 
 
 
252 aa  225  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.06 
 
 
251 aa  224  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  47.54 
 
 
248 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  46.37 
 
 
246 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  46.72 
 
 
254 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  48.94 
 
 
267 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  46.61 
 
 
251 aa  221  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  48.1 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  47.06 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  48.52 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  47.68 
 
 
248 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  47.68 
 
 
248 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  48.31 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  48.31 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  48.31 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  48.52 
 
 
248 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  47.88 
 
 
248 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  47.88 
 
 
248 aa  217  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  48.78 
 
 
245 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  48.78 
 
 
245 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  48.78 
 
 
245 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  49.12 
 
 
259 aa  215  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  48.1 
 
 
245 aa  214  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.35 
 
 
243 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  48.36 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  48.36 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  47.88 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  47.13 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  44.81 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  46.41 
 
 
248 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  45.61 
 
 
265 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  49.34 
 
 
263 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  48.5 
 
 
246 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  46.44 
 
 
271 aa  209  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  44.3 
 
 
246 aa  209  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  46.02 
 
 
243 aa  209  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  49.37 
 
 
248 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  46.84 
 
 
260 aa  208  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  50.21 
 
 
248 aa  208  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  50 
 
 
248 aa  208  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  49.79 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  49.79 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  49.79 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  49.79 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  49.79 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  49.79 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  49.79 
 
 
245 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  44.67 
 
 
245 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  49.57 
 
 
267 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  44.63 
 
 
244 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  48.02 
 
 
274 aa  204  8e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  45.58 
 
 
251 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  46.9 
 
 
258 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  47.44 
 
 
248 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  47.44 
 
 
248 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  45.13 
 
 
254 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  47.44 
 
 
248 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  47.44 
 
 
248 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  46.35 
 
 
246 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  45.61 
 
 
243 aa  202  6e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  47.01 
 
 
248 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  47.01 
 
 
248 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  47.01 
 
 
248 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  46.15 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  44.93 
 
 
265 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  46.15 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  46.15 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  46.78 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  45.81 
 
 
261 aa  198  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  45.81 
 
 
262 aa  198  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  45.31 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  43.27 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.96 
 
 
239 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  46.49 
 
 
254 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  46.02 
 
 
262 aa  194  9e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  46.02 
 
 
262 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  45.78 
 
 
254 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  43.67 
 
 
260 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4289  heme exporter protein CcmC  48.52 
 
 
248 aa  192  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000743229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  43.57 
 
 
244 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  44.96 
 
 
256 aa  192  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  43.5 
 
 
249 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  43.64 
 
 
270 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>