178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3254 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  100 
 
 		 248 aa  500  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  78.01 
 
 		 260 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  70.45 
 
 		 250 aa  368  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  72.36 
 
 		 250 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  70.45 
 
 		 247 aa  364  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  70.45 
 
 		 247 aa  363  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  67.61 
 
 		 252 aa  361  5.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  64.11 
 
 		 248 aa  329  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  64.11 
 
 		 248 aa  329  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  63.71 
 
 		 248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  63.31 
 
 		 248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  64.11 
 
 		 248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  63.31 
 
 		 248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  62.9 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  62.9 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  62.9 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  62.9 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  67.74 
 
 		 248 aa  322  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  63.49 
 
 		 248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  60.33 
 
 		 243 aa  318  6e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  66.39 
 
 		 248 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  60.32 
 
 		 245 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  60.32 
 
 		 245 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  60.32 
 
 		 245 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  59.27 
 
 		 248 aa  311  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  62.1 
 
 		 248 aa  304  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  57.09 
 
 		 245 aa  301  9e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  58.06 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  58.06 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  58.06 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  58.06 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  58.06 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  58.06 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  58.06 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  58.06 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  58.06 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0213  heme exporter protein CcmC  63.49 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  56.05 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  56.05 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  56.05 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  56.05 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  55.65 
 
 		 248 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  55.65 
 
 		 248 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  55.65 
 
 		 248 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  55.24 
 
 		 248 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  55.24 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  55.24 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4289  heme exporter protein CcmC  62.5 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  54.1 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  50.82 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  51.23 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  49.59 
 
 		 267 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  55.22 
 
 		 246 aa  261  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  51.05 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  49.79 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  48.58 
 
 		 252 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  48.58 
 
 		 252 aa  254  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 		 251 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  50 
 
 		 255 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  50 
 
 		 255 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  50 
 
 		 255 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  50.41 
 
 		 267 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0920  heme exporter protein CcmC  49.6 
 
 		 251 aa  244  8e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0889  heme exporter protein CcmC  49.19 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  52.74 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  49.59 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 		 243 aa  235  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  50.85 
 
 		 246 aa  232  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  45.93 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  48.29 
 
 		 271 aa  221  6e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  46.12 
 
 		 262 aa  221  7e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  45.69 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  48.13 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  48.25 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00215  heme exporter protein C; cytochrome C-type biogenesis protein  49.79 
 
 		 252 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  48.67 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  46.96 
 
 		 269 aa  215  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  50.22 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1958  heme exporter protein CcmC  50 
 
 		 247 aa  211  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  46.09 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  48.25 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  45.65 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  48.39 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  48.13 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  44.54 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  49.07 
 
 		 262 aa  208  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  49.07 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.9 
 
 		 248 aa  208  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1868  heme exporter protein CcmC  46.5 
 
 		 246 aa  207  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.995735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  46.88 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  50 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  47.06 
 
 		 247 aa  205  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  45.58 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  47.25 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  46.95 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  50 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  48.13 
 
 		 265 aa  201  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4002  heme exporter protein CcmC  48.48 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>