179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0889 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0889  heme exporter protein CcmC  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0920  heme exporter protein CcmC  98.8 
 
 
251 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  53.14 
 
 
252 aa  263  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  49.19 
 
 
248 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  51.25 
 
 
267 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.58 
 
 
251 aa  258  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  47.98 
 
 
252 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  48.58 
 
 
247 aa  257  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.18 
 
 
251 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  48.18 
 
 
247 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  49 
 
 
250 aa  256  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  47.98 
 
 
252 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  51.46 
 
 
260 aa  255  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  50.42 
 
 
254 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  49.6 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  48.35 
 
 
250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  50.82 
 
 
267 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  55.36 
 
 
250 aa  249  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  47.33 
 
 
251 aa  248  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  49.39 
 
 
245 aa  244  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  49.39 
 
 
245 aa  244  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  49.39 
 
 
245 aa  244  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  52.3 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  50.21 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  47.28 
 
 
243 aa  243  3e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  50.21 
 
 
248 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  50.21 
 
 
248 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  50.21 
 
 
248 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  47.37 
 
 
245 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  48.95 
 
 
245 aa  241  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  48.95 
 
 
245 aa  241  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  48.95 
 
 
245 aa  241  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  48.95 
 
 
245 aa  241  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  48.95 
 
 
245 aa  241  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  48.95 
 
 
245 aa  241  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  48.95 
 
 
245 aa  241  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  48.95 
 
 
245 aa  241  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  48.95 
 
 
245 aa  241  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  49.37 
 
 
248 aa  241  7e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  47.98 
 
 
248 aa  241  7e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  50 
 
 
255 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  49.37 
 
 
248 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  49.37 
 
 
248 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 
248 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  49.58 
 
 
255 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  50.81 
 
 
248 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  48.95 
 
 
248 aa  240  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  49.58 
 
 
255 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  51.65 
 
 
243 aa  240  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  49.16 
 
 
246 aa  238  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  47.98 
 
 
248 aa  238  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 
248 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  48.12 
 
 
248 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  48.12 
 
 
248 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  47.7 
 
 
248 aa  227  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  45.04 
 
 
246 aa  226  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  47.7 
 
 
248 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  47.7 
 
 
248 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  47.7 
 
 
248 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  47.7 
 
 
248 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  47.7 
 
 
248 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  47.7 
 
 
248 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  47.7 
 
 
248 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  47.7 
 
 
248 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  46.34 
 
 
246 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00215  heme exporter protein C; cytochrome C-type biogenesis protein  50.64 
 
 
252 aa  223  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  47.44 
 
 
271 aa  221  6e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4289  heme exporter protein CcmC  50.63 
 
 
248 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000743229 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  43.93 
 
 
262 aa  218  5e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  48.29 
 
 
254 aa  218  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  43.93 
 
 
262 aa  216  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0213  heme exporter protein CcmC  48.95 
 
 
248 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  43.51 
 
 
262 aa  215  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  46.35 
 
 
246 aa  215  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  46.72 
 
 
248 aa  214  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  43.15 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  44.77 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  45.3 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1958  heme exporter protein CcmC  47.28 
 
 
247 aa  211  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4002  heme exporter protein CcmC  43.72 
 
 
261 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  43.87 
 
 
274 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  43.62 
 
 
270 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  46.52 
 
 
244 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  45.64 
 
 
256 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1868  heme exporter protein CcmC  42.62 
 
 
246 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.995735  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  46.31 
 
 
256 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  44.98 
 
 
263 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  46.15 
 
 
265 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  44.44 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  44.59 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  44.93 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  44.44 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  46.9 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  40.33 
 
 
265 aa  195  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0587  heme exporter protein CcmC  48.96 
 
 
262 aa  195  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723748  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  43.03 
 
 
250 aa  194  9e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  43.03 
 
 
250 aa  194  9e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  43.29 
 
 
243 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  42.98 
 
 
243 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  41.08 
 
 
254 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>