176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0587 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0587  heme exporter protein CcmC  100 
 
 		 262 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  68.33 
 
 		 246 aa  354  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  66.94 
 
 		 245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  64.02 
 
 		 246 aa  321  7e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  63.82 
 
 		 254 aa  315  4e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  65.95 
 
 		 259 aa  311  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  67.11 
 
 		 247 aa  311  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4002  heme exporter protein CcmC  66.67 
 
 		 261 aa  311  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  60.8 
 
 		 256 aa  300  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  60.64 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  61.89 
 
 		 248 aa  295  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  60.4 
 
 		 256 aa  293  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  63.97 
 
 		 261 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  62.9 
 
 		 262 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  57.44 
 
 		 249 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  55.37 
 
 		 271 aa  267  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  55.36 
 
 		 274 aa  243  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  50.39 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  51.28 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  54.47 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  50 
 
 		 247 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  51.05 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  48.29 
 
 		 248 aa  221  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  50.43 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  50.43 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  47.88 
 
 		 243 aa  218  6e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  47.68 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 		 245 aa  215  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.88 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  46.84 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  48.51 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  47.03 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  48.51 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  48.51 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0920  heme exporter protein CcmC  48.96 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0889  heme exporter protein CcmC  48.96 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  50 
 
 		 246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  46.61 
 
 		 248 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  46.61 
 
 		 248 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  46.61 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.66 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  47.44 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  49.56 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  46.58 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  46.58 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  46.61 
 
 		 248 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  46.61 
 
 		 248 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  46.61 
 
 		 248 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  46.61 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  47.23 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  46.19 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  48.95 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  49.36 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  45.76 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  49.36 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  47.01 
 
 		 248 aa  205  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  48.51 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  47.66 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  47.66 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  47.66 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  47.66 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  47.66 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  47.66 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  47.66 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  47.66 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  47.66 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  48.1 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  48.09 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  48.09 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  48.09 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  48.09 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  48.09 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  48.09 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  48.09 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  48.09 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  48.09 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  48.09 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  44.77 
 
 		 248 aa  198  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  48.29 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  41.83 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  46.38 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  43.21 
 
 		 265 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00215  heme exporter protein C; cytochrome C-type biogenesis protein  47.23 
 
 		 252 aa  188  9e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  47.37 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  48.23 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  43.67 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  47.35 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  43.15 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  43.62 
 
 		 262 aa  185  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  45.58 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  45.61 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  39.83 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  44.63 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  39.83 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  44.4 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  48.4 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  44.4 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  46.98 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0213  heme exporter protein CcmC  46.41 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>