173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0188 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  100 
 
 		 248 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  87.1 
 
 		 248 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  87.1 
 
 		 248 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  86.69 
 
 		 248 aa  441  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  87.1 
 
 		 248 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  92.74 
 
 		 248 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  86.69 
 
 		 248 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  86.29 
 
 		 248 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  86.29 
 
 		 248 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  86.29 
 
 		 248 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  85.89 
 
 		 248 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  82.26 
 
 		 248 aa  424  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  85.48 
 
 		 248 aa  418  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  87.1 
 
 		 248 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4289  heme exporter protein CcmC  90.32 
 
 		 248 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0213  heme exporter protein CcmC  89.11 
 
 		 248 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  68.42 
 
 		 250 aa  343  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  68.31 
 
 		 250 aa  339  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  67.77 
 
 		 252 aa  338  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  67.74 
 
 		 248 aa  337  8e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  66.94 
 
 		 247 aa  337  8e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  66.53 
 
 		 247 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  64.49 
 
 		 248 aa  324  9e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  62.45 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  60.82 
 
 		 245 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  60.82 
 
 		 245 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  60.82 
 
 		 245 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  59.18 
 
 		 245 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  59.68 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  59.68 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  59.68 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  59.68 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  59.68 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  59.68 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  59.68 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  59.68 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  59.68 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  56.38 
 
 		 243 aa  291  7e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  54.25 
 
 		 252 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  56.07 
 
 		 254 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  55.14 
 
 		 250 aa  277  9e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  54.73 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  55.37 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  57.66 
 
 		 248 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  57.66 
 
 		 248 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  57.26 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  57.26 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  56.2 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  56.85 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  56.85 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  53.72 
 
 		 251 aa  271  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  56.85 
 
 		 248 aa  271  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  56.85 
 
 		 248 aa  271  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  56.85 
 
 		 248 aa  271  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  56.85 
 
 		 248 aa  271  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  53.78 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  54.25 
 
 		 246 aa  265  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  55.23 
 
 		 255 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  55.23 
 
 		 255 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  54.81 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  52.89 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  54.55 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  53.94 
 
 		 243 aa  242  5e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  54.84 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  47.37 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1958  heme exporter protein CcmC  52.87 
 
 		 247 aa  235  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  50 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  53.09 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0889  heme exporter protein CcmC  50.81 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0920  heme exporter protein CcmC  50.41 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  50.84 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  51.12 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  50.21 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  50.67 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  51.11 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  48.95 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00215  heme exporter protein C; cytochrome C-type biogenesis protein  53.72 
 
 		 252 aa  224  7e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  51.24 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  51.08 
 
 		 263 aa  218  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  50.21 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  47.54 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  48.35 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  47.81 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  49.55 
 
 		 256 aa  210  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  49.34 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  48.32 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  45.04 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  48.26 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  50.21 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  46.43 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  49.17 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  44.86 
 
 		 270 aa  208  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  50.21 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  49.12 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  45.99 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  50.21 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  47.62 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  45.08 
 
 		 243 aa  206  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  46.47 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  45.08 
 
 		 243 aa  205  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>