179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0038 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  100 
 
 
239 aa  474  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  59.24 
 
 
244 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  58.4 
 
 
244 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  57.81 
 
 
254 aa  281  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  55.51 
 
 
243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  57.45 
 
 
265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  58.16 
 
 
251 aa  273  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  56.07 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  53.81 
 
 
243 aa  269  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  61.16 
 
 
254 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  57.38 
 
 
256 aa  269  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  58.08 
 
 
269 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  57.87 
 
 
254 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  58.44 
 
 
256 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  58.3 
 
 
258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  54.89 
 
 
261 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  54.89 
 
 
262 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  60.7 
 
 
243 aa  262  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  57.98 
 
 
244 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  53.19 
 
 
265 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  57.81 
 
 
253 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  54.62 
 
 
270 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  56.12 
 
 
253 aa  258  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  60.59 
 
 
250 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  53.59 
 
 
250 aa  252  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  56.5 
 
 
250 aa  251  5.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  56.78 
 
 
268 aa  248  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  50.22 
 
 
259 aa  249  4e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  55.93 
 
 
268 aa  247  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  55.93 
 
 
268 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  54.39 
 
 
243 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  62.67 
 
 
255 aa  241  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  50.21 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  50.89 
 
 
250 aa  238  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  52.19 
 
 
247 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  52.19 
 
 
247 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  49.17 
 
 
252 aa  235  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  53.68 
 
 
238 aa  234  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  49.34 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.77 
 
 
234 aa  231  7.000000000000001e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  49.56 
 
 
248 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  49.56 
 
 
248 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  49.12 
 
 
248 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  49.12 
 
 
248 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  49.12 
 
 
248 aa  229  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  49.56 
 
 
248 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  49.56 
 
 
248 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  49.56 
 
 
248 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  48.26 
 
 
250 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  49.12 
 
 
248 aa  228  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.83 
 
 
251 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  48.96 
 
 
248 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  48.67 
 
 
248 aa  226  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.83 
 
 
251 aa  225  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  52.99 
 
 
243 aa  224  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  53.36 
 
 
245 aa  224  8e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  53.36 
 
 
245 aa  224  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  53.36 
 
 
245 aa  224  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  52.84 
 
 
249 aa  224  9e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  51.09 
 
 
246 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  49.78 
 
 
260 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  45.65 
 
 
267 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  46.96 
 
 
254 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  46.67 
 
 
236 aa  223  3e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  46.88 
 
 
248 aa  222  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  45.98 
 
 
234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  47.83 
 
 
251 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  48.25 
 
 
245 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  48.26 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  53.88 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  49.34 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  48.26 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  48.26 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  50 
 
 
245 aa  218  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  50 
 
 
245 aa  218  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  50 
 
 
245 aa  218  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  50 
 
 
245 aa  218  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  50 
 
 
245 aa  218  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  50 
 
 
245 aa  218  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  50 
 
 
245 aa  218  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  50 
 
 
245 aa  218  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  50 
 
 
245 aa  218  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  49.79 
 
 
259 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1387  heme exporter protein CcmC  51.06 
 
 
242 aa  217  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  49.12 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  50 
 
 
271 aa  215  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  50.45 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  48.2 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  48.55 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  47.83 
 
 
267 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  48.7 
 
 
248 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  48.09 
 
 
263 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  48.7 
 
 
248 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  48.26 
 
 
248 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  50.48 
 
 
243 aa  209  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  48.26 
 
 
248 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  48.26 
 
 
248 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  48.26 
 
 
248 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  48.26 
 
 
248 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  48.26 
 
 
248 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>