More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2302 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
230 aa  464  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  50.71 
 
 
239 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  41.18 
 
 
254 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  40.5 
 
 
225 aa  148  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  39.05 
 
 
234 aa  146  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  38.19 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  38.6 
 
 
231 aa  145  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  38.81 
 
 
244 aa  142  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  40.45 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  43.02 
 
 
230 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  35.96 
 
 
225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  37.13 
 
 
230 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  39.13 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  34.24 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  35.03 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  30.62 
 
 
261 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  30.62 
 
 
262 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  30.69 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  31.9 
 
 
256 aa  111  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  36.47 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  33.17 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  35.2 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  33.65 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  29.26 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  33.51 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  33.33 
 
 
250 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  33.18 
 
 
268 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  36.31 
 
 
268 aa  108  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  35 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  35.52 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  35.35 
 
 
247 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  34.47 
 
 
238 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  32.72 
 
 
236 aa  106  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  30.48 
 
 
256 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  34.08 
 
 
253 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  34.64 
 
 
253 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  30.1 
 
 
259 aa  104  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.12 
 
 
247 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  34.67 
 
 
269 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.64 
 
 
263 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  34.5 
 
 
247 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1387  heme exporter protein CcmC  32.86 
 
 
242 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  34.07 
 
 
246 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  32.7 
 
 
262 aa  102  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  33.74 
 
 
234 aa  102  5e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  31.07 
 
 
246 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  34.93 
 
 
250 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  35 
 
 
248 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  35 
 
 
248 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  35 
 
 
248 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  35 
 
 
248 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  33.17 
 
 
248 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4002  heme exporter protein CcmC  35.36 
 
 
261 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  34.66 
 
 
248 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  36.92 
 
 
251 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  34.25 
 
 
245 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  34.66 
 
 
248 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  36.17 
 
 
236 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  34.91 
 
 
249 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  32.04 
 
 
244 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.36 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  29.21 
 
 
248 aa  99.4  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  36.17 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  34.09 
 
 
248 aa  99  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  31.82 
 
 
250 aa  98.6  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  37.57 
 
 
254 aa  99  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  34.09 
 
 
248 aa  99  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  34.09 
 
 
248 aa  99  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  32.66 
 
 
252 aa  98.2  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.92 
 
 
239 aa  98.2  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  30.65 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  32.13 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  33.52 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  31.34 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  31.34 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  33 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  33.91 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  32.13 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.24 
 
 
243 aa  96.3  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  34.22 
 
 
248 aa  95.9  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  32.8 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  31.64 
 
 
244 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  34.16 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  31.46 
 
 
267 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.66 
 
 
251 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  30.11 
 
 
246 aa  95.9  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  34.18 
 
 
274 aa  95.5  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  34.22 
 
 
248 aa  95.5  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  30 
 
 
254 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  30.65 
 
 
243 aa  95.5  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  33.52 
 
 
255 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0509  CcmC family heme exporter protein  33.52 
 
 
233 aa  94.7  9e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0176154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  33.7 
 
 
243 aa  95.1  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  33.52 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  33.52 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  38.16 
 
 
319 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  40.71 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  31.07 
 
 
244 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0213  heme exporter protein CcmC  35.26 
 
 
248 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  40.71 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>