More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0985 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 234 aa  461  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  65.52 
 
 		 230 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  59.91 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  63.24 
 
 		 230 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  60 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  63.45 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  48.92 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  40.67 
 
 		 239 aa  175  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  39.42 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  39.05 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  33.06 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  36.55 
 
 		 235 aa  124  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  33.69 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  32.14 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  28.77 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  29.72 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  29.72 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  32.14 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  31.22 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  35.71 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  32.43 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  36.67 
 
 		 319 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  34.92 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  35.16 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  30.58 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  32.38 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  35.9 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  31.25 
 
 		 260 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  33.51 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  31.28 
 
 		 250 aa  99  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  30.41 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0509  CcmC family heme exporter protein  28.38 
 
 		 233 aa  98.2  8e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0176154  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  32.29 
 
 		 259 aa  98.2  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  33.51 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  29.33 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  30.19 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  27.18 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  32.91 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.89 
 
 		 251 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  31.61 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  30.37 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  29.47 
 
 		 265 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.41 
 
 		 267 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  29.9 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  29.9 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  27.72 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  30.57 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  30.93 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  29.9 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.77 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.37 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  26.67 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  29.81 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  29.81 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  33.33 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  30.17 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  28.64 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  30.99 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  30.94 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  28.57 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  29.77 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  26.77 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  28.44 
 
 		 244 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  29.69 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  35.92 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  28.22 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  29.56 
 
 		 247 aa  89.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  31.75 
 
 		 271 aa  89.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  26.83 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  32.5 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  30.14 
 
 		 267 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  37.18 
 
 		 321 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  31.58 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  31.76 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  33.54 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  35.42 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  27.62 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  27.62 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4369  cytochrome c assembly protein  37.18 
 
 		 321 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  27.62 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  27.62 
 
 		 248 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  27.36 
 
 		 268 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  27.23 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  30.57 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  27.36 
 
 		 268 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  26.87 
 
 		 268 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  27.32 
 
 		 269 aa  85.5  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  30.2 
 
 		 242 aa  85.1  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  28.87 
 
 		 245 aa  85.1  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  29.21 
 
 		 243 aa  85.1  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  27.23 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  31.29 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  26.58 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  26.29 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1387  heme exporter protein CcmC  28.21 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  27.23 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  26.73 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  26.73 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  26.73 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  28.57 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>