More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0837 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 230 aa  458  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  62.72 
 
 		 232 aa  278  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  45.6 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  43.75 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  43.65 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  37.36 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  41.33 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  43.52 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  43.55 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  43.17 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  41.4 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  39.68 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  41.67 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  41.4 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  40.29 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  40.49 
 
 		 238 aa  138  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  38.97 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  38.97 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  41.36 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  41.24 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  37.16 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  37.95 
 
 		 256 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  39.81 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  37.76 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  38.43 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  42.47 
 
 		 250 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  38.14 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  39.23 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  42.26 
 
 		 274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  40.78 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  36.16 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  39.89 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  36.76 
 
 		 234 aa  131  6.999999999999999e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  37.33 
 
 		 260 aa  131  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  36.45 
 
 		 256 aa  131  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  38.3 
 
 		 265 aa  131  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  38.05 
 
 		 248 aa  131  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  36.16 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  38.05 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  38.05 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  38.05 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  38.07 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  37.2 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  39.02 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  37.2 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  37.2 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  35.98 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  38.16 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  37.2 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  38.57 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  37.74 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  40.11 
 
 		 268 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  37.56 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  36.71 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.08 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  41.01 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  37.68 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  38.98 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  38.94 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  37.82 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  37.68 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  36.1 
 
 		 245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  38.42 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  37.07 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  33.69 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  37.62 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  36.76 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  39.62 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4002  heme exporter protein CcmC  40 
 
 		 261 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  39.62 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  37.56 
 
 		 250 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  34.92 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  35.44 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  35.44 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  38.34 
 
 		 248 aa  121  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  32.76 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  36.05 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  34.89 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  36.5 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  36 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  36.28 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  36.11 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  40.1 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1387  heme exporter protein CcmC  38.19 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  35.61 
 
 		 256 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  39.71 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  38.89 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  33.65 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  37.17 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  36.64 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  36.23 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.65 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  38.95 
 
 		 242 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1001  heme exporter protein CcmC  36.22 
 
 		 244 aa  118  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.114267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  32.63 
 
 		 224 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  34.21 
 
 		 249 aa  118  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  38.95 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  32.33 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  36.89 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>