More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03790 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 225 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  46.6 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  48.92 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  49.18 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  42 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  44.72 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  41.1 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  44.2 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  42.71 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  38.07 
 
 		 235 aa  149  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  40.5 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  37.36 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  36.41 
 
 		 244 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  36.9 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  38.71 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  29.91 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  30.49 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  35.71 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  35.9 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.85 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  36.87 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  35.56 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0509  CcmC family heme exporter protein  37.89 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0176154  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  35.68 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.6 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  35.68 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  36.07 
 
 		 265 aa  115  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  36.76 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  32.83 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  35.23 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  31.22 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  34.03 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  34.33 
 
 		 254 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  35.83 
 
 		 254 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  32.16 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  35.29 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  30 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  31.77 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  33.33 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  34.21 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 271 aa  108  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  32.12 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  35.67 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  33.51 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  36.02 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  34.97 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1387  heme exporter protein CcmC  31.52 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  33.18 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  33.18 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  30.5 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  34.22 
 
 		 250 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  33.87 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  34.24 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  31.78 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  33.85 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  34.16 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  32.47 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  30.26 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  34.24 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  33.51 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  31.9 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  32 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  31.07 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.11 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.93 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  31.96 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  32.82 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  38.26 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  32.97 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.97 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  32.32 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  34.1 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  30.54 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  29.89 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  33.68 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  33.68 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  32.32 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  33.68 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  34.71 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  31.43 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  34.22 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  33.16 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  31.31 
 
 		 258 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  34.04 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  32.46 
 
 		 248 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  30.35 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  32.46 
 
 		 248 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  30 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.61 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  33.71 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  31.94 
 
 		 248 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  31.94 
 
 		 248 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  31.94 
 
 		 248 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  32.63 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  31.94 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  31.28 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  31.94 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  31.94 
 
 		 248 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>