More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2505 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  64.68 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  64.65 
 
 		 228 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  62.81 
 
 		 230 aa  241  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  61.58 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  56.25 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  42.99 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  41.1 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  38.57 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  38.86 
 
 		 254 aa  144  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  40 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  34.34 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  32.41 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  34.74 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  34.36 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  33.7 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  36.68 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  39.72 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  32.7 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  27.96 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  32.7 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  35.59 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  32.4 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  32.86 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  31.75 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  32.16 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  32.63 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  32.47 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  32.47 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  32.2 
 
 		 254 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  28.26 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  33.55 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  31.86 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.01 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  33.85 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  32.67 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  29.68 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.77 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  33.03 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  31.44 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  30.88 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  30.96 
 
 		 254 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.28 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  32.86 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  28.5 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  29.67 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  29.19 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.42 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  32.38 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  31.35 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  36.88 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  30.15 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  30.15 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  29.47 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  29.47 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  29.6 
 
 		 265 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  29.9 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  30.7 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  29.65 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  31.58 
 
 		 250 aa  98.6  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  33.52 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  29.06 
 
 		 251 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  33.18 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  25.98 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  30.38 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  28.44 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  29.86 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  28.95 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  28.95 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.41 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  28.95 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  28.95 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.12 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  28.23 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  30.05 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  28.38 
 
 		 267 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.28 
 
 		 263 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  28 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  29.85 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  26.55 
 
 		 247 aa  95.5  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  32.86 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  29.95 
 
 		 248 aa  95.5  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  34.19 
 
 		 259 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  29.47 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  31.21 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  33.72 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  28.29 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  32.97 
 
 		 319 aa  94.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  32.2 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  26.94 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  31.63 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  30.3 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1387  heme exporter protein CcmC  30.3 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  28.64 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  28.27 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  29.35 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  27.88 
 
 		 246 aa  92.8  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  29.35 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  30.33 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  30.81 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>