More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3129 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  74.27 
 
 		 224 aa  322  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  71.84 
 
 		 230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  66.52 
 
 		 230 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  60.37 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  59.9 
 
 		 234 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  46.8 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  42.51 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  41.38 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  40.69 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  39.27 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  40.86 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  37.26 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  35.94 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  36.51 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  34.74 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  37.16 
 
 		 254 aa  121  8e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  33.52 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  35.48 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  32.88 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  33.94 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  33.94 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  32.23 
 
 		 234 aa  111  8.000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  38.3 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.63 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  32.51 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  35.53 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  31.02 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  35.59 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  36.46 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  35.35 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  34.38 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  33.67 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  35.41 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  34.85 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  32.5 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  28.89 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  30.99 
 
 		 271 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.13 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  35.82 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  34.64 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  32.61 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  29.84 
 
 		 259 aa  99.4  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  30 
 
 		 245 aa  98.6  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  34.16 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  32.43 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.99 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0509  CcmC family heme exporter protein  28.44 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0176154  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  30.5 
 
 		 249 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  32.7 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  33.5 
 
 		 254 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  32.49 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  31.31 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  31.34 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  32.78 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  30.17 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  30.17 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  32.7 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  30.17 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  33.15 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  30.91 
 
 		 274 aa  95.1  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  34.94 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  31.32 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  31.38 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  34.81 
 
 		 319 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  33.5 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  37.13 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  28.73 
 
 		 246 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  32.77 
 
 		 244 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.05 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  30.43 
 
 		 248 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  30.43 
 
 		 248 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  30.54 
 
 		 248 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  34.45 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  30.2 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  29.89 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  29.89 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  29.89 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  30.86 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  38.42 
 
 		 321 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  29.89 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.402873 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  29.83 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  29.83 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0587  heme exporter protein CcmC  34.69 
 
 		 262 aa  89.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  29.83 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  29.89 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  32.76 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  29.83 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  29.83 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  29.83 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  29.89 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  29.83 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  29.83 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  29.83 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  29.89 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  29.28 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  27.98 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  36.08 
 
 		 320 aa  88.6  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  33.94 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>