More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0238 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  45.54 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  46.6 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  51.72 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.45 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  42.99 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  45.11 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  42.86 
 
 		 224 aa  178  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  41.29 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  44.02 
 
 		 230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  39.11 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  39.61 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  42.01 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  42.21 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  37.67 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  37.12 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  37.44 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  41.21 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  41.62 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  36.28 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  39.11 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  36.7 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  34.73 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  35.15 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  34.73 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  41.9 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  41.18 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  36.11 
 
 		 265 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  36.67 
 
 		 246 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  38.05 
 
 		 265 aa  141  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  37.72 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  35.78 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  40.54 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  37.31 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  38.05 
 
 		 248 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  38.05 
 
 		 248 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  34.33 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  39.29 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  39.52 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  39.15 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  38.18 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  39.15 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  33.79 
 
 		 251 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  33.77 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  37.62 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.5 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  36.46 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  36.07 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  34.7 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  37.88 
 
 		 243 aa  135  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  39.46 
 
 		 256 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  35.5 
 
 		 255 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  33.79 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  36.98 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  36.98 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  36.06 
 
 		 250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  40.1 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  36.41 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  34.75 
 
 		 244 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  34.08 
 
 		 243 aa  135  8e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  37.91 
 
 		 271 aa  134  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  39.34 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  36.46 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  36.46 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  36.36 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  35.82 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.57 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  37.5 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  38.62 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0509  CcmC family heme exporter protein  38.22 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0176154  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  34.67 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  38.62 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  38.62 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  39.79 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  39.79 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  39.79 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  37.5 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  36.57 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  36.41 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  35.71 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  38.1 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  37.73 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  37.11 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  34.72 
 
 		 236 aa  132  5e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  33.05 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  38.22 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  38.32 
 
 		 248 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  37.27 
 
 		 249 aa  132  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  37.31 
 
 		 270 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.13 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  38.74 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  35.94 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  41.25 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  34.38 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  36.41 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1387  heme exporter protein CcmC  36.45 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  35.22 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  38.89 
 
 		 268 aa  128  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  38.01 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>