More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0981 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  100 
 
 
235 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  40.62 
 
 
231 aa  161  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  37.93 
 
 
225 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  44.44 
 
 
228 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  43.24 
 
 
224 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  39.09 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  35.09 
 
 
239 aa  142  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  38.07 
 
 
234 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  37.73 
 
 
246 aa  136  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  36.81 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  38.97 
 
 
230 aa  135  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  43.79 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  31.97 
 
 
256 aa  131  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  33.17 
 
 
254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  36.41 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  34.09 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  33.8 
 
 
261 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  33.8 
 
 
262 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  35.38 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  33.78 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  33.92 
 
 
244 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  33.5 
 
 
265 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  33.48 
 
 
244 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  33.18 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  42.25 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  35.14 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  33.04 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  34.36 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  34.23 
 
 
253 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  34.04 
 
 
244 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  33.51 
 
 
244 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  33.81 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  35.05 
 
 
254 aa  106  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  36.92 
 
 
236 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  33.92 
 
 
258 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.17 
 
 
251 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.74 
 
 
267 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  29.17 
 
 
250 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  33.16 
 
 
268 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.66 
 
 
251 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  32.65 
 
 
268 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  31.86 
 
 
251 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  33.51 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  31.6 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  28.32 
 
 
251 aa  99  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  35.11 
 
 
250 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  32.14 
 
 
268 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  30.85 
 
 
242 aa  98.2  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  31.19 
 
 
265 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  35.11 
 
 
225 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  29.87 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  28.45 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  27.43 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  26.56 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  35.92 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  36.77 
 
 
319 aa  96.3  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  29.86 
 
 
254 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1523  cytochrome c assembly protein  30.93 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  30.04 
 
 
267 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  28.71 
 
 
254 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  28.95 
 
 
250 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  29.47 
 
 
255 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  29.47 
 
 
255 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1001  heme exporter protein CcmC  30.29 
 
 
244 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.114267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  28.93 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  27.73 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  29.23 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  30.39 
 
 
270 aa  91.7  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  30.53 
 
 
254 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  29.87 
 
 
236 aa  91.7  9e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  29.21 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  29.86 
 
 
221 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  25.45 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  30.09 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  29.69 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  25.82 
 
 
246 aa  89.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  35.34 
 
 
274 aa  89.7  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.17 
 
 
234 aa  89.4  4e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  34.42 
 
 
321 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  32.58 
 
 
271 aa  89.4  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  30.3 
 
 
247 aa  89  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  32.48 
 
 
242 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  32.48 
 
 
244 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  32.79 
 
 
269 aa  88.6  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.19 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  27.16 
 
 
247 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  28.49 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  25.85 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  28.49 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  32.88 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  26.74 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  27.96 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  28.49 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3840  cytochrome c assembly protein  32.66 
 
 
240 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  28.49 
 
 
252 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0920  heme exporter protein CcmC  30.08 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.15 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  31.4 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0889  heme exporter protein CcmC  28.57 
 
 
251 aa  85.5  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  26.85 
 
 
249 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>