204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0936 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  63.18 
 
 
230 aa  259  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  45.55 
 
 
236 aa  168  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  42.77 
 
 
254 aa  155  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  42.53 
 
 
239 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  40.93 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  39.18 
 
 
244 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  38.66 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  40.57 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  38.66 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  38 
 
 
262 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  38 
 
 
261 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  39.61 
 
 
244 aa  126  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  37.82 
 
 
243 aa  125  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  34.67 
 
 
225 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  38.04 
 
 
262 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  38.14 
 
 
253 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  37.82 
 
 
244 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  38.46 
 
 
265 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  35.26 
 
 
229 aa  121  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  37.36 
 
 
256 aa  121  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  38.04 
 
 
261 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  38.42 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  36.73 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  41.67 
 
 
274 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  41.71 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  36.67 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  37.31 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  37.31 
 
 
265 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  38.54 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  35.87 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  37.36 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  35.58 
 
 
230 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  37.21 
 
 
258 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  39.18 
 
 
243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.06 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  37.93 
 
 
247 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  38.32 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  38.55 
 
 
268 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  38.32 
 
 
262 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  36.68 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  33.01 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  37.36 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1387  heme exporter protein CcmC  35.12 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  38.55 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  36.02 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  37.99 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  37.85 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  32.99 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  36.26 
 
 
262 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  37.86 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  36.65 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  34.13 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  39.01 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  35.76 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  43.51 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0509  CcmC family heme exporter protein  35.45 
 
 
233 aa  108  7.000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0176154  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  37.18 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  42.2 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  35.59 
 
 
228 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  31.5 
 
 
254 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  36.82 
 
 
251 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  37.43 
 
 
254 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0587  heme exporter protein CcmC  36.18 
 
 
262 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723748  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  33.49 
 
 
248 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  33.16 
 
 
248 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  33.16 
 
 
248 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  33.03 
 
 
248 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  33.16 
 
 
248 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  33.03 
 
 
248 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  33.03 
 
 
248 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  33.16 
 
 
248 aa  105  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  32.66 
 
 
248 aa  105  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  36.92 
 
 
250 aa  105  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  36.92 
 
 
250 aa  105  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  34.42 
 
 
248 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4002  heme exporter protein CcmC  36.97 
 
 
261 aa  104  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  35.26 
 
 
230 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  35.35 
 
 
249 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  32.09 
 
 
248 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.71 
 
 
267 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  32.14 
 
 
248 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  33.71 
 
 
243 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  36.31 
 
 
250 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 
256 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.36 
 
 
250 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  36 
 
 
248 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  32.87 
 
 
248 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  34.44 
 
 
256 aa  102  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.93 
 
 
251 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.17 
 
 
234 aa  100  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  35.03 
 
 
243 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  38.06 
 
 
247 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  38.06 
 
 
247 aa  99.8  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  32.11 
 
 
248 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  34.83 
 
 
254 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  33.53 
 
 
251 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  37.29 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  34.27 
 
 
255 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  33.15 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>