296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3361 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  37.72 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  36.02 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  34.34 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  37.43 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  35.35 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  30.49 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  37.27 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  32.14 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  38.22 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  37.41 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  33.5 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  32.68 
 
 		 246 aa  98.6  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  35.11 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 256 aa  95.5  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  33.73 
 
 		 254 aa  90.1  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  28.64 
 
 		 265 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  32.02 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0509  CcmC family heme exporter protein  27.35 
 
 		 233 aa  85.5  7e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0176154  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  27.94 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  29.91 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  29.91 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  31.34 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  31.02 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  28.64 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  30.43 
 
 		 269 aa  81.6  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  29.8 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  30.34 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  29.95 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  26.42 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  27.54 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  29.11 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  32.24 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  31.13 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1001  heme exporter protein CcmC  29.87 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.114267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.03 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  29.38 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  25.7 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.14 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  29.65 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  27.35 
 
 		 271 aa  78.2  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  29.67 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  29.67 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  29.67 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  29.67 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  29.67 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  27.27 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  29.67 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  29.67 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  27.8 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  29.67 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  29.67 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  26.15 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.44 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  28.16 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  27.95 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  26.15 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  25.6 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  26.52 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  27.46 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  27.32 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  27.32 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  27.32 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  25.23 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  30.04 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  29.82 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  28.99 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  30.65 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  31.79 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  28.96 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  30.65 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  30.11 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  27.56 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  30.11 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  30.41 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  32.88 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  28.75 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  30.11 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  30.11 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  28.99 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  30.11 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  29.65 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  30.11 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  30.11 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  30.11 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  27.09 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.19 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  28.64 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  34 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  29.38 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  28.43 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  31.61 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  26.9 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  27.51 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  25.73 
 
 		 256 aa  72  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  27.59 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  27.78 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>