263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2580 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 256 aa  520  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  51.75 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  52.94 
 
 		 246 aa  271  7e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  39.38 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  42.77 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  39.8 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  41.53 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  38.71 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  37.85 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  35.38 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  31.56 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  34.74 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  36.87 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  34.81 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  30.48 
 
 		 230 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  36.94 
 
 		 319 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  33.53 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  36.36 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  38.02 
 
 		 232 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3221  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 		 219 aa  96.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  35.67 
 
 		 321 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 225 aa  95.5  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4369  cytochrome c assembly protein  37.58 
 
 		 321 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  28.93 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4437  cytochrome c assembly protein  36.84 
 
 		 335 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  31.82 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  30.17 
 
 		 243 aa  85.9  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  31.15 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  27.92 
 
 		 256 aa  85.9  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0755  cytochrome c assembly protein  36.09 
 
 		 335 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  27.54 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  31.15 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  27.54 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  31.69 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  29.51 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  32.33 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3840  cytochrome c assembly protein  31.38 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  28.21 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  28.21 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  27.81 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  29.83 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  30.27 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  28.5 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  29.8 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  29.74 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  28 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  24.49 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.71 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  26.67 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  30.3 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  28.57 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  28.42 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.78 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  27.5 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  29.23 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  27.32 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  27.32 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.83 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  27.87 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  28 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  28.72 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  28.21 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  27.5 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  28.81 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  26.67 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  30.37 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  27.84 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  27 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  25 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  25.54 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  26.36 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  29.17 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  26.92 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  27 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  28.11 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  25.47 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  32.43 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  30.05 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  27.32 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  26.02 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  28.42 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  28.42 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  33.88 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  28.27 
 
 		 247 aa  72  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  27.66 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  30.41 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.07 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  31.55 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  28.41 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  27.57 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  33.06 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  26.29 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  26.11 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  27.89 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  29.38 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0587  heme exporter protein CcmC  29.03 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1853  heme exporter protein C  26.09 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.024303  normal  0.648082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  32 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  28.22 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>