170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2426 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 242 aa  484  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3221  cytochrome c assembly protein  46.53 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  46.95 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  44.55 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1523  cytochrome c assembly protein  41.43 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3840  cytochrome c assembly protein  41.13 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5083  cytochrome c assembly protein  39.91 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.402739  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  40.65 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  40.12 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4369  cytochrome c assembly protein  41.01 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0755  cytochrome c assembly protein  43.62 
 
 		 335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4437  cytochrome c assembly protein  42.86 
 
 		 335 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  38.41 
 
 		 320 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  32.49 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  31.79 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  33.33 
 
 		 235 aa  91.7  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  28.93 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  30.2 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  30.58 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  30.51 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  31.12 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  32.69 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  29.51 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  29.65 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  30.06 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  28.51 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  28.57 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  26.2 
 
 		 225 aa  72  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  34.38 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.06 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  32.35 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  29.59 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  32.02 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  29.58 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  28.99 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  31.08 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  32.35 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  30.22 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  27.76 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  30.2 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  31.12 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  30.77 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  27.85 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  28.43 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  29.29 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  25.78 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.59 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  27.67 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  29.36 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  29.27 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  28.43 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  26.98 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  28.57 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  30.37 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  26.51 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  29.76 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  32.62 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  26.05 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  32.62 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  30.87 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  29.35 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  30.32 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  28.79 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  29.26 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  29.26 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  30.33 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  28.72 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  28.42 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  28.72 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  28.72 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  28.72 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  28.24 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  28.72 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0587  heme exporter protein CcmC  28.5 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  28.72 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  28.72 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  28.72 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  27.66 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1853  heme exporter protein C  27.54 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.024303  normal  0.648082 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1001  heme exporter protein CcmC  27.27 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.114267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  26.74 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  29.69 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  28.06 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  31.43 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  26.77 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  30.07 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  24.19 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  26.7 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  26.7 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  29.93 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  28.78 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  30.26 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1958  heme exporter protein CcmC  30.37 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  25.76 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  27.78 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  27.37 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  24.56 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  27.23 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  27.23 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1387  heme exporter protein CcmC  29.33 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>