204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1447 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3840  cytochrome c assembly protein  68.49 
 
 		 240 aa  325  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5083  cytochrome c assembly protein  66.36 
 
 		 227 aa  296  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.402739  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  59.35 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3221  cytochrome c assembly protein  54.67 
 
 		 219 aa  249  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1523  cytochrome c assembly protein  47.91 
 
 		 220 aa  211  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  47.98 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  38.54 
 
 		 319 aa  108  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0755  cytochrome c assembly protein  44.9 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4437  cytochrome c assembly protein  42.77 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  43.45 
 
 		 320 aa  99.4  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  39.77 
 
 		 321 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  32.66 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4369  cytochrome c assembly protein  38.01 
 
 		 321 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  29.53 
 
 		 239 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  34.36 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  29.53 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  29.83 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  34.07 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  35.85 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  34.03 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  31.09 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  30.41 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  29.65 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  29.08 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  30.05 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  34.21 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.35 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  29.09 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  30.82 
 
 		 247 aa  72  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  30.23 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  26.67 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  32.19 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  27.32 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  27.32 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  27.32 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  29.71 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  27.11 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  30.41 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  30.41 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  30.83 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  28.57 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  29.45 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  29.68 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  29.01 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  29.01 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  32.12 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  28.08 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  28.12 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.59 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  30.28 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  31.48 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  34.81 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  28.74 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  24.51 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  24.51 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  27.71 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  24.51 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  25.13 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  24.51 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  24.51 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  24.51 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  24.51 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  24.51 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  23.9 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  24.51 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  34.56 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  27.4 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  28.26 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  34.56 
 
 		 253 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.11 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.18 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  28.57 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  23.66 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  31.54 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  27.71 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  29.33 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  26.42 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  27.11 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  28.57 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  24.73 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  24.73 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  28.65 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  28.65 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  22.58 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  26.74 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.14 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  33.09 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  28 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  24.19 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  24.19 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  23.16 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  29.32 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0587  heme exporter protein CcmC  26.71 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  23.66 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  28.44 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  23.66 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  23.66 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  23.66 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>