211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1619 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  100 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  99.19 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  63.05 
 
 		 256 aa  322  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  66.53 
 
 		 250 aa  311  5.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  66.53 
 
 		 250 aa  311  5.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00215  heme exporter protein C; cytochrome C-type biogenesis protein  54.47 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  49.18 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  45.73 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  42.56 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  41.32 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  49.22 
 
 		 247 aa  192  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  42.67 
 
 		 271 aa  191  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  50 
 
 		 247 aa  191  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.57 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  42.74 
 
 		 274 aa  188  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  44.04 
 
 		 259 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  43.64 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  38.02 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  40.08 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  38.02 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  44.21 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  41.67 
 
 		 267 aa  181  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  40.08 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  39.02 
 
 		 246 aa  181  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  43.33 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  38.33 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  40.68 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  39.58 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  42.32 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  42.32 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  46.07 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  42.32 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  47.57 
 
 		 245 aa  175  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  45.03 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  41.35 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  46.77 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  46.77 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  46.77 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  46.77 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  46.77 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  46.77 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  46.77 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  46.77 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  46.77 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  42.15 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  42.15 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  44.5 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  46.6 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  46.6 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  46.6 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  46.6 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  42.56 
 
 		 248 aa  171  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  44.02 
 
 		 248 aa  171  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  40.08 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  46.07 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  46.7 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  46.07 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  46.07 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  42.15 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  42.15 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  46.07 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  46.07 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  40.25 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  46.07 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  39.58 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4002  heme exporter protein CcmC  40.66 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  40.25 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  46.39 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  46.39 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  46.99 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  46.39 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  46.39 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  45.13 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  42.21 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  38.02 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  38.66 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  47.83 
 
 		 244 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  46.03 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  44.51 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  41.56 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  44.21 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  44.21 
 
 		 248 aa  164  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  43.81 
 
 		 260 aa  164  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  43.81 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  40.71 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  44.26 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  41.08 
 
 		 267 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  38.71 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0920  heme exporter protein CcmC  38.27 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  39.82 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  41.85 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  41.07 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1958  heme exporter protein CcmC  44.56 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0889  heme exporter protein CcmC  37.86 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  40.36 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  46.11 
 
 		 248 aa  158  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  49.68 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  49.03 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  43.23 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  37.13 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>