More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3568 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 321 aa  644    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4369  cytochrome c assembly protein  90.97 
 
 		 321 aa  570  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  68.67 
 
 		 319 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4437  cytochrome c assembly protein  61.01 
 
 		 335 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0755  cytochrome c assembly protein  60.25 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  43.3 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  40.91 
 
 		 242 aa  125  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  44.09 
 
 		 230 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  39.77 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  40.51 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  39.1 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  35.9 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  35.67 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  38.42 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3221  cytochrome c assembly protein  34.03 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  39.88 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  37.2 
 
 		 256 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3840  cytochrome c assembly protein  37.04 
 
 		 240 aa  99.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  37.18 
 
 		 234 aa  99  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  35.06 
 
 		 232 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1523  cytochrome c assembly protein  36.93 
 
 		 220 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  34.05 
 
 		 265 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  36.91 
 
 		 239 aa  95.9  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  35.29 
 
 		 254 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  36.05 
 
 		 230 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 240 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  37.65 
 
 		 253 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  34.07 
 
 		 247 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  37.06 
 
 		 253 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  35.71 
 
 		 235 aa  93.2  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  35.56 
 
 		 259 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  36.3 
 
 		 271 aa  92.8  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  33.33 
 
 		 260 aa  92.8  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  35.53 
 
 		 246 aa  92.8  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  33.55 
 
 		 256 aa  92.4  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  36.13 
 
 		 261 aa  92.4  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.7 
 
 		 234 aa  92.4  9e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  36.13 
 
 		 262 aa  92.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 		 247 aa  92.4  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  37.19 
 
 		 236 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  38.73 
 
 		 256 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  33.92 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  33.53 
 
 		 230 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  34.94 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  37.06 
 
 		 244 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  32.08 
 
 		 225 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  36.05 
 
 		 224 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  34.3 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  34.56 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  33.14 
 
 		 244 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  34.75 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  36.65 
 
 		 249 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.81 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.44 
 
 		 243 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  35.03 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  34.39 
 
 		 268 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  35.03 
 
 		 268 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  38.76 
 
 		 250 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  38.76 
 
 		 250 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  31.95 
 
 		 243 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0587  heme exporter protein CcmC  37.78 
 
 		 262 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  31.9 
 
 		 247 aa  86.3  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.95 
 
 		 250 aa  85.9  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  29.76 
 
 		 246 aa  85.9  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  37.5 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  32 
 
 		 234 aa  85.5  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  34.27 
 
 		 245 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  37.31 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  34.29 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  30.72 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  31.17 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  32.5 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  36.13 
 
 		 243 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  37.76 
 
 		 254 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.07 
 
 		 239 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  36.3 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  37.19 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  36.3 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  29.76 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  37.6 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  37.6 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  33.57 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  33.57 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 229 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  29.82 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  29.82 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  30.72 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1853  heme exporter protein C  33.87 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.024303  normal  0.648082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  34.16 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  29.22 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  32.21 
 
 		 246 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  31.47 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  35.43 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  31.47 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  31.58 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  31.29 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  31.47 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5083  cytochrome c assembly protein  33.75 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.402739  normal  0.75907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>