More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4369 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4369  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
321 aa  644    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  90.97 
 
 
321 aa  581  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  67.72 
 
 
319 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4437  cytochrome c assembly protein  59.75 
 
 
335 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0755  cytochrome c assembly protein  59.62 
 
 
335 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  42.37 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  41.29 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  39.85 
 
 
254 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  42.52 
 
 
230 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  37.58 
 
 
256 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  38.01 
 
 
221 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  37.65 
 
 
244 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  39.86 
 
 
230 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  37.18 
 
 
234 aa  102  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3221  cytochrome c assembly protein  33.13 
 
 
219 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  36.59 
 
 
256 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  36.88 
 
 
254 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  33.17 
 
 
265 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  36.36 
 
 
232 aa  99.4  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  38.15 
 
 
228 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  36.05 
 
 
230 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3840  cytochrome c assembly protein  35.8 
 
 
240 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 
254 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  34.5 
 
 
260 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  36.47 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  36.91 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  37.78 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  37.86 
 
 
235 aa  93.6  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  34.71 
 
 
253 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  34.81 
 
 
247 aa  93.6  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  35.39 
 
 
244 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 
225 aa  92.4  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  35.03 
 
 
244 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  34.34 
 
 
254 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  38.03 
 
 
256 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  39.26 
 
 
255 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  34.07 
 
 
247 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  32.64 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  36.73 
 
 
244 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  35.37 
 
 
224 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  34.19 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.29 
 
 
243 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  34.19 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  35.54 
 
 
236 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  32.9 
 
 
256 aa  90.1  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1523  cytochrome c assembly protein  33.93 
 
 
220 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  38.89 
 
 
249 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  37.04 
 
 
263 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  33.12 
 
 
271 aa  89.4  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  35.03 
 
 
268 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  32.56 
 
 
265 aa  89.4  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  33.55 
 
 
246 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  32.54 
 
 
243 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  34.39 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  31.69 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  35.03 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.37 
 
 
234 aa  88.2  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  39.53 
 
 
250 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  39.53 
 
 
250 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  35.29 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  34.75 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  32.35 
 
 
230 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  39.07 
 
 
243 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  36 
 
 
270 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  34.27 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  33.57 
 
 
243 aa  84  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  30.36 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.07 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  30.67 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.62 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  37.59 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  28.48 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0587  heme exporter protein CcmC  36.3 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723748  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  30.16 
 
 
262 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  36.42 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  31.41 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  37.21 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  36.13 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  32.47 
 
 
256 aa  79  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  38.02 
 
 
242 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  34.59 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  36.36 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  31.36 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  36.36 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  37.6 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  30.61 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  30.61 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  35 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  35 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0509  CcmC family heme exporter protein  30.82 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0176154  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  31.48 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  33.33 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1853  heme exporter protein C  35.96 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.024303  normal  0.648082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  31.15 
 
 
238 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  37.1 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1958  heme exporter protein CcmC  34.75 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  31.47 
 
 
250 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.12 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  31.29 
 
 
252 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>