143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3840 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3840  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  68.49 
 
 		 221 aa  325  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5083  cytochrome c assembly protein  59.82 
 
 		 227 aa  275  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.402739  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  52.84 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3221  cytochrome c assembly protein  49.77 
 
 		 219 aa  240  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1523  cytochrome c assembly protein  46.73 
 
 		 220 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  44.02 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  38.79 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  38.82 
 
 		 320 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  37.04 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0755  cytochrome c assembly protein  39.51 
 
 		 335 aa  89  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4437  cytochrome c assembly protein  41.1 
 
 		 335 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  31.38 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  37.41 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4369  cytochrome c assembly protein  35.8 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  34.27 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  29.41 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  33.08 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  29.84 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  28.04 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  28.02 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  34.31 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  29.51 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  32.12 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.69 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  35.56 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  32.68 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  26.47 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  30.18 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  27.13 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  23.35 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  25.86 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  31.11 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  30.66 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  28.42 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  24.21 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  30.23 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  23.08 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  30.46 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  27.74 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  24.34 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  31.39 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  27.41 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  26.42 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  26.42 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  29.03 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  29.2 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  27.11 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  28.36 
 
 		 274 aa  52  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  25.9 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  23.94 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  25.84 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  25.4 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  25.4 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  25.4 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  25.37 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  23.2 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  22.6 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  26.28 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0813  cytochrome c assembly protein  35.19 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.444267  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  25.37 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0861  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.19 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0865  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.19 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  25.13 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  27.74 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  24.69 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  24.69 
 
 		 247 aa  48.9  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  27.32 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  29.63 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  23.89 
 
 		 246 aa  48.5  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  31.9 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  36.25 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  26.9 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  22.64 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.86 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  27.01 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  25.82 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0705  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.85 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  28.31 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  29.93 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  28.47 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  26.28 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.04 
 
 		 333 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  27.72 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  22.51 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  24.29 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  23.53 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  23.53 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1574  cytochrome c biogenesis protein  34.38 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0338041 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1486  cytochrome c assembly protein  26.17 
 
 		 319 aa  45.4  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  22.99 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  22.99 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  31.94 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  40.98 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  22.99 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  26 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  24.26 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  24.26 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  22.99 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  22.99 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>