53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1486 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1486  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 319 aa  623  1e-177  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0933  hypothetical protein  66.67 
 
 		 125 aa  149  8e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0016394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1523  cytochrome c assembly protein  30.28 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  31.14 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4437  cytochrome c assembly protein  29.69 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  30.36 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  30.18 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  43.28 
 
 		 242 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  41.43 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  43.28 
 
 		 244 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  26.28 
 
 		 221 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  37.04 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0755  cytochrome c assembly protein  29.29 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  32.43 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  38.81 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5083  cytochrome c assembly protein  29.86 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.402739  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  28.66 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  30.66 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  30.63 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  31.86 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  30.63 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  29.1 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1001  heme exporter protein CcmC  38.57 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.114267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1411  heme exporter protein CcmC  35.82 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11561  normal  0.597775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  28.68 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  27.65 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  28.42 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  30 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  32.93 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  29.91 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  24.31 
 
 		 240 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 268 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  29.91 
 
 		 243 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 268 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  27.27 
 
 		 253 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.91 
 
 		 243 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 229 aa  45.8  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  28.18 
 
 		 253 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  29.46 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  32.5 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  26.92 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  28.83 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3840  cytochrome c assembly protein  26.17 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  27.08 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0705  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  32.95 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3221  cytochrome c assembly protein  26.44 
 
 		 219 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.06 
 
 		 234 aa  43.9  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  27.07 
 
 		 234 aa  43.5  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  32.63 
 
 		 254 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  32.63 
 
 		 254 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  27.64 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  30.83 
 
 		 265 aa  42.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>