263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1411 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1411  heme exporter protein CcmC  100 
 
 		 241 aa  481  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11561  normal  0.597775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1853  heme exporter protein C  73.14 
 
 		 243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.024303  normal  0.648082 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  74.38 
 
 		 242 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  74.38 
 
 		 244 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1001  heme exporter protein CcmC  74.17 
 
 		 244 aa  349  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.114267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  73.86 
 
 		 247 aa  348  5e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  75.21 
 
 		 242 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  49.57 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  48.29 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  47.86 
 
 		 244 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  47.44 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  50 
 
 		 244 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  46.06 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  43.88 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  41.95 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  42.61 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  42.61 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  45.85 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  44.89 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  46.58 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  41.1 
 
 		 251 aa  185  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  42.29 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  42.29 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  42.29 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  42.42 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  46.29 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  42.68 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  41.95 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  41.1 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  41.1 
 
 		 255 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  43.17 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  40.68 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  41 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  42.54 
 
 		 260 aa  178  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  41.6 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  42.48 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  42.79 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  43.23 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  42.04 
 
 		 247 aa  175  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  40.08 
 
 		 245 aa  175  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  44 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  41.59 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  44.59 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  43.5 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  43.5 
 
 		 268 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  44.59 
 
 		 251 aa  171  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  39.82 
 
 		 248 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  44 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  40.25 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  40.27 
 
 		 248 aa  171  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  39.82 
 
 		 248 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  39.82 
 
 		 248 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  39.75 
 
 		 250 aa  170  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  39.65 
 
 		 260 aa  170  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  41.15 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  48.2 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  40.79 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  43.1 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  39.38 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  41.03 
 
 		 248 aa  167  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  39.38 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  39.38 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  39.38 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  39.26 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  39.26 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  39.26 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  38.84 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  38.84 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  38.94 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  38.84 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  38.84 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  41.56 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  38.84 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  38.84 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  38.84 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  38.84 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  38.84 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  42.17 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  44.64 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  42.17 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  44.05 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  42.04 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  43.61 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  40.08 
 
 		 248 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  40.08 
 
 		 248 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  37.71 
 
 		 248 aa  164  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  40.08 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  40.08 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  42.37 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  40.08 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  40.08 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  40.08 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  40.08 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  41.88 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  42.29 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  39.65 
 
 		 246 aa  161  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0889  heme exporter protein CcmC  40.26 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  40.91 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  41.7 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  40.87 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>