208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5083 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5083  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.402739  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  66.36 
 
 		 221 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3840  cytochrome c assembly protein  59.82 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  51.35 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3221  cytochrome c assembly protein  49.77 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1523  cytochrome c assembly protein  48.13 
 
 		 220 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  40.76 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  35.42 
 
 		 319 aa  89  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  33.73 
 
 		 320 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  31.34 
 
 		 239 aa  84.7  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0755  cytochrome c assembly protein  37.91 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4437  cytochrome c assembly protein  37.91 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  32.37 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  30 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.95 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  33.75 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  32.06 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  30.77 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  26.96 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  27.41 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  31.54 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  31.65 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  28.26 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  35.86 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  30.77 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  31.47 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  26.54 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  31.65 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  30.71 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  32.14 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.22 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  31.54 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  32.67 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4369  cytochrome c assembly protein  31.1 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  30.16 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  29.87 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  25.91 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  25.54 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  29.5 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  26.21 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  26.9 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  24.77 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  25.77 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  31.96 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  27.67 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  24.84 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  26.04 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  27.14 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  25 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  22.11 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  27.89 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  22.11 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1486  cytochrome c assembly protein  29.86 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  22.11 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  23.9 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  26.54 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  25.66 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  24.74 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  29.71 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  26.09 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  30.77 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  28.57 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  35 
 
 		 262 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  31.01 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  25.93 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  25.93 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  27.59 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  26.9 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  26.9 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  30.71 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  35 
 
 		 262 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  24.31 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  28.19 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1387  heme exporter protein CcmC  26.09 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  29.94 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  26.71 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1853  heme exporter protein C  23.42 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.024303  normal  0.648082 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  25 
 
 		 246 aa  51.6  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  28.57 
 
 		 256 aa  51.6  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  26 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  24.23 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  23.2 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0749  cytochrome c assembly protein  43.24 
 
 		 472 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  28.79 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  29.9 
 
 		 262 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  24.36 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  25.48 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  25.48 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  25.48 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  23.35 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  26.4 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  21.62 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  26 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  26 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  30.87 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  25.48 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  25.48 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  25.88 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  25.5 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  31.01 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>