286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4437 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4437  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 335 aa  670    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0755  cytochrome c assembly protein  94.03 
 
 		 335 aa  614  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  61.01 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  59.37 
 
 		 319 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4369  cytochrome c assembly protein  59.75 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  48.05 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  45.51 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  42.59 
 
 		 221 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3221  cytochrome c assembly protein  35.76 
 
 		 219 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  37.01 
 
 		 232 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  36.31 
 
 		 254 aa  98.6  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  38.41 
 
 		 234 aa  97.8  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  39.01 
 
 		 254 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3840  cytochrome c assembly protein  41.1 
 
 		 240 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  36.84 
 
 		 256 aa  96.3  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  36.81 
 
 		 240 aa  95.9  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  40.5 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  36.54 
 
 		 239 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.74 
 
 		 230 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  33.15 
 
 		 225 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1523  cytochrome c assembly protein  34.38 
 
 		 220 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  37.19 
 
 		 236 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  32.44 
 
 		 265 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  40.29 
 
 		 230 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  36.96 
 
 		 230 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  38.4 
 
 		 256 aa  85.9  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  36.49 
 
 		 228 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  34.23 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  36.84 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  33.95 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  33.95 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  36.49 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  33.58 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  32.92 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  35.8 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5083  cytochrome c assembly protein  37.91 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.402739  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  36.3 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  32.52 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  33.96 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  32.52 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  32.88 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  35.22 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  34.75 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  32.1 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  34.75 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  36.3 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  31.18 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  33.54 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.91 
 
 		 243 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  34.33 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  32.94 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  34.07 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  32.94 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  35.56 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  38.24 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  32.5 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  35.71 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  30.88 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  37.96 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  34.36 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  33.53 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  32.67 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  34.97 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.41 
 
 		 234 aa  75.5  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  33.57 
 
 		 243 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  33.12 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  32.5 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  31.87 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  29.02 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  30.15 
 
 		 247 aa  72  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  37.5 
 
 		 250 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  30.15 
 
 		 247 aa  72  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  36.75 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  37.5 
 
 		 250 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  36.62 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  33.57 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  30.67 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1853  heme exporter protein C  33.59 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.024303  normal  0.648082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  36.8 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  31.71 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  34.52 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  34.38 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  36.42 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  34.46 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.92 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  34.92 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  31.03 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  33.59 
 
 		 242 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  32.02 
 
 		 245 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 246 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  35.2 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  33.59 
 
 		 244 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  36.14 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  35.59 
 
 		 255 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  32.19 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  30.65 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  32.19 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  31.07 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>