More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2719 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
320 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  47.17 
 
 
319 aa  279  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  43.3 
 
 
321 aa  259  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0755  cytochrome c assembly protein  46.95 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4437  cytochrome c assembly protein  48.05 
 
 
335 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4369  cytochrome c assembly protein  42.37 
 
 
321 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  43.45 
 
 
221 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  37.42 
 
 
242 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  35.15 
 
 
240 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3840  cytochrome c assembly protein  38.82 
 
 
240 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  36.08 
 
 
228 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3221  cytochrome c assembly protein  32.75 
 
 
219 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  35.8 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  34.46 
 
 
225 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  37.16 
 
 
224 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  36.92 
 
 
254 aa  97.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  40.16 
 
 
230 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  37.67 
 
 
230 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  34.9 
 
 
230 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  36 
 
 
234 aa  93.2  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  39.73 
 
 
244 aa  92.4  9e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  32.33 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  34.38 
 
 
254 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  37.06 
 
 
232 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  37.1 
 
 
235 aa  89.7  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  30.87 
 
 
265 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  32.35 
 
 
236 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  36.22 
 
 
256 aa  85.9  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5083  cytochrome c assembly protein  33.73 
 
 
227 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.402739  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  32.26 
 
 
231 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  32.7 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  34.42 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1523  cytochrome c assembly protein  34.29 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  32.58 
 
 
261 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  32.58 
 
 
262 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  31.9 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  31.76 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  29.63 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  29.85 
 
 
246 aa  79  0.00000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  37.58 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  31.25 
 
 
234 aa  79  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  33.99 
 
 
271 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  34.09 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  29.51 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  29.24 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  30.9 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0587  heme exporter protein CcmC  32.45 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723748  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  33.54 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  29.73 
 
 
247 aa  77  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  28.73 
 
 
236 aa  77  0.0000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  31.18 
 
 
254 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  29.73 
 
 
247 aa  77  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  32.12 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  33.56 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  33.93 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  32.37 
 
 
259 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  31.33 
 
 
256 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  32.57 
 
 
249 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  32.41 
 
 
244 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  36.71 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  30.77 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  36.71 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  33.57 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  34.27 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  36.08 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  29.33 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.24 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.96 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  30 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.63 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  32.24 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  34.15 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  34.15 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  28.57 
 
 
256 aa  72.4  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0509  CcmC family heme exporter protein  32.67 
 
 
233 aa  72  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0176154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  29.66 
 
 
243 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4002  heme exporter protein CcmC  31.48 
 
 
261 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  27.17 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  28.83 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  33.09 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  31.1 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  30 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  30.66 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  32.37 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  32.37 
 
 
242 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.21 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  31.39 
 
 
261 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  31.65 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  25.97 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  29.25 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.25 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  30 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  35.37 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  29.11 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  30.52 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  33.1 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1853  heme exporter protein C  30.47 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.024303  normal  0.648082 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  30.71 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  31.58 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  29.68 
 
 
246 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>